Protein–RNA interactions for Protein: P06340

HLA-DOA, HLA class II histocompatibility antigen, DO alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DOAP06340 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HLA-DOAP06340 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HLA-DOAP06340 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HLA-DOAP06340 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HLA-DOAP06340 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HLA-DOAP06340 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HLA-DOAP06340 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
HLA-DOAP06340 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HLA-DOAP06340 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HLA-DOAP06340 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HLA-DOAP06340 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HLA-DOAP06340 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HLA-DOAP06340 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HLA-DOAP06340 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HLA-DOAP06340 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HLA-DOAP06340 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HLA-DOAP06340 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HLA-DOAP06340 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HLA-DOAP06340 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HLA-DOAP06340 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HLA-DOAP06340 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HLA-DOAP06340 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HLA-DOAP06340 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HLA-DOAP06340 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HLA-DOAP06340 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HLA-DOAP06340 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HLA-DOAP06340 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HLA-DOAP06340 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HLA-DOAP06340 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HLA-DOAP06340 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HLA-DOAP06340 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HLA-DOAP06340 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HLA-DOAP06340 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
HLA-DOAP06340 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HLA-DOAP06340 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HLA-DOAP06340 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HLA-DOAP06340 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HLA-DOAP06340 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HLA-DOAP06340 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HLA-DOAP06340 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HLA-DOAP06340 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HLA-DOAP06340 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HLA-DOAP06340 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HLA-DOAP06340 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HLA-DOAP06340 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HLA-DOAP06340 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HLA-DOAP06340 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HLA-DOAP06340 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HLA-DOAP06340 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HLA-DOAP06340 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HLA-DOAP06340 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HLA-DOAP06340 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HLA-DOAP06340 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HLA-DOAP06340 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HLA-DOAP06340 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HLA-DOAP06340 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HLA-DOAP06340 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HLA-DOAP06340 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HLA-DOAP06340 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
HLA-DOAP06340 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HLA-DOAP06340 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HLA-DOAP06340 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HLA-DOAP06340 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HLA-DOAP06340 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HLA-DOAP06340 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
HLA-DOAP06340 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HLA-DOAP06340 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HLA-DOAP06340 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HLA-DOAP06340 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HLA-DOAP06340 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HLA-DOAP06340 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HLA-DOAP06340 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HLA-DOAP06340 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
HLA-DOAP06340 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
HLA-DOAP06340 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
HLA-DOAP06340 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HLA-DOAP06340 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
HLA-DOAP06340 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HLA-DOAP06340 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HLA-DOAP06340 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HLA-DOAP06340 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HLA-DOAP06340 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
HLA-DOAP06340 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HLA-DOAP06340 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HLA-DOAP06340 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HLA-DOAP06340 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HLA-DOAP06340 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HLA-DOAP06340 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HLA-DOAP06340 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HLA-DOAP06340 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HLA-DOAP06340 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HLA-DOAP06340 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HLA-DOAP06340 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HLA-DOAP06340 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
HLA-DOAP06340 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HLA-DOAP06340 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HLA-DOAP06340 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HLA-DOAP06340 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HLA-DOAP06340 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HLA-DOAP06340 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms