Protein–RNA interactions for Protein: P01008

SERPINC1, Antithrombin-III, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERPINC1P01008 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SERPINC1P01008 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SERPINC1P01008 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SERPINC1P01008 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SERPINC1P01008 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SERPINC1P01008 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SERPINC1P01008 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SERPINC1P01008 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SERPINC1P01008 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SERPINC1P01008 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SERPINC1P01008 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SERPINC1P01008 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SERPINC1P01008 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SERPINC1P01008 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SERPINC1P01008 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SERPINC1P01008 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SERPINC1P01008 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SERPINC1P01008 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SERPINC1P01008 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SERPINC1P01008 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SERPINC1P01008 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SERPINC1P01008 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SERPINC1P01008 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SERPINC1P01008 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SERPINC1P01008 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SERPINC1P01008 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SERPINC1P01008 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SERPINC1P01008 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.15
SERPINC1P01008 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SERPINC1P01008 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SERPINC1P01008 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SERPINC1P01008 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SERPINC1P01008 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SERPINC1P01008 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SERPINC1P01008 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SERPINC1P01008 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SERPINC1P01008 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SERPINC1P01008 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SERPINC1P01008 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SERPINC1P01008 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SERPINC1P01008 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SERPINC1P01008 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SERPINC1P01008 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SERPINC1P01008 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SERPINC1P01008 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SERPINC1P01008 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SERPINC1P01008 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SERPINC1P01008 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SERPINC1P01008 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SERPINC1P01008 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SERPINC1P01008 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SERPINC1P01008 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SERPINC1P01008 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SERPINC1P01008 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SERPINC1P01008 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SERPINC1P01008 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SERPINC1P01008 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SERPINC1P01008 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SERPINC1P01008 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SERPINC1P01008 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SERPINC1P01008 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SERPINC1P01008 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SERPINC1P01008 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SERPINC1P01008 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SERPINC1P01008 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SERPINC1P01008 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SERPINC1P01008 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SERPINC1P01008 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SERPINC1P01008 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SERPINC1P01008 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SERPINC1P01008 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SERPINC1P01008 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SERPINC1P01008 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SERPINC1P01008 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SERPINC1P01008 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SERPINC1P01008 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SERPINC1P01008 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SERPINC1P01008 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SERPINC1P01008 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SERPINC1P01008 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SERPINC1P01008 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SERPINC1P01008 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SERPINC1P01008 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SERPINC1P01008 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SERPINC1P01008 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SERPINC1P01008 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SERPINC1P01008 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SERPINC1P01008 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SERPINC1P01008 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SERPINC1P01008 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SERPINC1P01008 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SERPINC1P01008 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SERPINC1P01008 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SERPINC1P01008 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SERPINC1P01008 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SERPINC1P01008 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SERPINC1P01008 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SERPINC1P01008 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SERPINC1P01008 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SERPINC1P01008 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms