Protein–RNA interactions for Protein: O95983

MBD3, Methyl-CpG-binding domain protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD3O95983 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
MBD3O95983 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
MBD3O95983 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
MBD3O95983 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MBD3O95983 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MBD3O95983 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
MBD3O95983 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
MBD3O95983 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MBD3O95983 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
MBD3O95983 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MBD3O95983 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MBD3O95983 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MBD3O95983 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MBD3O95983 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MBD3O95983 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MBD3O95983 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MBD3O95983 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MBD3O95983 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MBD3O95983 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MBD3O95983 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MBD3O95983 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MBD3O95983 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MBD3O95983 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MBD3O95983 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MBD3O95983 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MBD3O95983 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MBD3O95983 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MBD3O95983 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MBD3O95983 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MBD3O95983 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MBD3O95983 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MBD3O95983 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MBD3O95983 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MBD3O95983 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MBD3O95983 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MBD3O95983 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
MBD3O95983 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
MBD3O95983 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
MBD3O95983 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MBD3O95983 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MBD3O95983 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MBD3O95983 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MBD3O95983 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MBD3O95983 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MBD3O95983 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MBD3O95983 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MBD3O95983 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MBD3O95983 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MBD3O95983 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
MBD3O95983 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MBD3O95983 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MBD3O95983 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
MBD3O95983 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MBD3O95983 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MBD3O95983 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MBD3O95983 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MBD3O95983 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MBD3O95983 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MBD3O95983 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MBD3O95983 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MBD3O95983 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
MBD3O95983 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MBD3O95983 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MBD3O95983 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MBD3O95983 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MBD3O95983 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MBD3O95983 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MBD3O95983 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MBD3O95983 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
MBD3O95983 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MBD3O95983 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MBD3O95983 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MBD3O95983 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MBD3O95983 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MBD3O95983 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MBD3O95983 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MBD3O95983 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MBD3O95983 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MBD3O95983 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MBD3O95983 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
MBD3O95983 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MBD3O95983 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MBD3O95983 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MBD3O95983 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MBD3O95983 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MBD3O95983 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MBD3O95983 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MBD3O95983 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MBD3O95983 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MBD3O95983 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MBD3O95983 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MBD3O95983 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MBD3O95983 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MBD3O95983 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
MBD3O95983 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MBD3O95983 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MBD3O95983 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MBD3O95983 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MBD3O95983 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MBD3O95983 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms