Protein–RNA interactions for Protein: O94769

ECM2, Extracellular matrix protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM2O94769 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
ECM2O94769 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ECM2O94769 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
ECM2O94769 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ECM2O94769 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ECM2O94769 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ECM2O94769 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ECM2O94769 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ECM2O94769 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ECM2O94769 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ECM2O94769 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ECM2O94769 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ECM2O94769 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ECM2O94769 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ECM2O94769 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ECM2O94769 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ECM2O94769 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ECM2O94769 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
ECM2O94769 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ECM2O94769 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
ECM2O94769 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ECM2O94769 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ECM2O94769 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ECM2O94769 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ECM2O94769 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ECM2O94769 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ECM2O94769 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ECM2O94769 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ECM2O94769 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ECM2O94769 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ECM2O94769 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ECM2O94769 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ECM2O94769 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ECM2O94769 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ECM2O94769 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ECM2O94769 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ECM2O94769 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
ECM2O94769 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ECM2O94769 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ECM2O94769 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ECM2O94769 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ECM2O94769 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
ECM2O94769 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ECM2O94769 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ECM2O94769 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ECM2O94769 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ECM2O94769 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ECM2O94769 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ECM2O94769 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ECM2O94769 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ECM2O94769 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ECM2O94769 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
ECM2O94769 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
ECM2O94769 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ECM2O94769 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ECM2O94769 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ECM2O94769 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ECM2O94769 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
ECM2O94769 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ECM2O94769 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ECM2O94769 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ECM2O94769 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ECM2O94769 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
ECM2O94769 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ECM2O94769 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ECM2O94769 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ECM2O94769 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ECM2O94769 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ECM2O94769 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ECM2O94769 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ECM2O94769 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ECM2O94769 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ECM2O94769 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ECM2O94769 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ECM2O94769 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ECM2O94769 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ECM2O94769 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ECM2O94769 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ECM2O94769 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ECM2O94769 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
ECM2O94769 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ECM2O94769 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
ECM2O94769 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ECM2O94769 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ECM2O94769 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ECM2O94769 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ECM2O94769 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ECM2O94769 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ECM2O94769 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ECM2O94769 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ECM2O94769 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ECM2O94769 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ECM2O94769 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ECM2O94769 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ECM2O94769 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ECM2O94769 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ECM2O94769 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ECM2O94769 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
ECM2O94769 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ECM2O94769 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms