Protein–RNA interactions for Protein: O75334

PPFIA2, Liprin-alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,257 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA2O75334 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PPFIA2O75334 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PPFIA2O75334 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PPFIA2O75334 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PPFIA2O75334 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PPFIA2O75334 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PPFIA2O75334 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
PPFIA2O75334 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PPFIA2O75334 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PPFIA2O75334 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PPFIA2O75334 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PPFIA2O75334 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PPFIA2O75334 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PPFIA2O75334 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PPFIA2O75334 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PPFIA2O75334 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PPFIA2O75334 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PPFIA2O75334 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PPFIA2O75334 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PPFIA2O75334 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PPFIA2O75334 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PPFIA2O75334 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PPFIA2O75334 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PPFIA2O75334 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PPFIA2O75334 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PPFIA2O75334 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PPFIA2O75334 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PPFIA2O75334 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PPFIA2O75334 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PPFIA2O75334 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PPFIA2O75334 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PPFIA2O75334 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PPFIA2O75334 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PPFIA2O75334 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PPFIA2O75334 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PPFIA2O75334 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PPFIA2O75334 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PPFIA2O75334 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PPFIA2O75334 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PPFIA2O75334 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PPFIA2O75334 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PPFIA2O75334 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PPFIA2O75334 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PPFIA2O75334 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PPFIA2O75334 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PPFIA2O75334 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PPFIA2O75334 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
PPFIA2O75334 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PPFIA2O75334 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PPFIA2O75334 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PPFIA2O75334 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PPFIA2O75334 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PPFIA2O75334 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PPFIA2O75334 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PPFIA2O75334 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PPFIA2O75334 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PPFIA2O75334 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PPFIA2O75334 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PPFIA2O75334 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PPFIA2O75334 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PPFIA2O75334 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PPFIA2O75334 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PPFIA2O75334 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PPFIA2O75334 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PPFIA2O75334 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PPFIA2O75334 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
PPFIA2O75334 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PPFIA2O75334 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PPFIA2O75334 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PPFIA2O75334 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PPFIA2O75334 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PPFIA2O75334 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PPFIA2O75334 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
PPFIA2O75334 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
PPFIA2O75334 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PPFIA2O75334 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PPFIA2O75334 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PPFIA2O75334 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PPFIA2O75334 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PPFIA2O75334 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PPFIA2O75334 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PPFIA2O75334 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PPFIA2O75334 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PPFIA2O75334 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PPFIA2O75334 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PPFIA2O75334 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PPFIA2O75334 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
PPFIA2O75334 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PPFIA2O75334 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PPFIA2O75334 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PPFIA2O75334 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PPFIA2O75334 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PPFIA2O75334 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PPFIA2O75334 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PPFIA2O75334 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PPFIA2O75334 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PPFIA2O75334 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PPFIA2O75334 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PPFIA2O75334 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PPFIA2O75334 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms