Protein–RNA interactions for Protein: O75154

RAB11FIP3, Rab11 family-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP3O75154 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RAB11FIP3O75154 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RAB11FIP3O75154 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RAB11FIP3O75154 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RAB11FIP3O75154 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RAB11FIP3O75154 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RAB11FIP3O75154 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
RAB11FIP3O75154 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RAB11FIP3O75154 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RAB11FIP3O75154 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RAB11FIP3O75154 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RAB11FIP3O75154 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RAB11FIP3O75154 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RAB11FIP3O75154 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RAB11FIP3O75154 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RAB11FIP3O75154 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RAB11FIP3O75154 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RAB11FIP3O75154 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RAB11FIP3O75154 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RAB11FIP3O75154 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RAB11FIP3O75154 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RAB11FIP3O75154 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RAB11FIP3O75154 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RAB11FIP3O75154 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RAB11FIP3O75154 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RAB11FIP3O75154 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RAB11FIP3O75154 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RAB11FIP3O75154 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RAB11FIP3O75154 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RAB11FIP3O75154 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RAB11FIP3O75154 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RAB11FIP3O75154 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RAB11FIP3O75154 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RAB11FIP3O75154 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
RAB11FIP3O75154 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RAB11FIP3O75154 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RAB11FIP3O75154 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RAB11FIP3O75154 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RAB11FIP3O75154 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RAB11FIP3O75154 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RAB11FIP3O75154 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RAB11FIP3O75154 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RAB11FIP3O75154 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RAB11FIP3O75154 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RAB11FIP3O75154 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RAB11FIP3O75154 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RAB11FIP3O75154 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RAB11FIP3O75154 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RAB11FIP3O75154 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RAB11FIP3O75154 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RAB11FIP3O75154 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RAB11FIP3O75154 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RAB11FIP3O75154 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
RAB11FIP3O75154 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RAB11FIP3O75154 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RAB11FIP3O75154 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RAB11FIP3O75154 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RAB11FIP3O75154 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RAB11FIP3O75154 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RAB11FIP3O75154 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RAB11FIP3O75154 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RAB11FIP3O75154 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RAB11FIP3O75154 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RAB11FIP3O75154 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RAB11FIP3O75154 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RAB11FIP3O75154 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RAB11FIP3O75154 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RAB11FIP3O75154 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
RAB11FIP3O75154 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RAB11FIP3O75154 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
RAB11FIP3O75154 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
RAB11FIP3O75154 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
RAB11FIP3O75154 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RAB11FIP3O75154 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RAB11FIP3O75154 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RAB11FIP3O75154 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RAB11FIP3O75154 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RAB11FIP3O75154 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RAB11FIP3O75154 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
RAB11FIP3O75154 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RAB11FIP3O75154 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RAB11FIP3O75154 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
RAB11FIP3O75154 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RAB11FIP3O75154 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RAB11FIP3O75154 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RAB11FIP3O75154 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RAB11FIP3O75154 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RAB11FIP3O75154 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RAB11FIP3O75154 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RAB11FIP3O75154 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RAB11FIP3O75154 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
RAB11FIP3O75154 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RAB11FIP3O75154 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RAB11FIP3O75154 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RAB11FIP3O75154 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RAB11FIP3O75154 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RAB11FIP3O75154 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RAB11FIP3O75154 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RAB11FIP3O75154 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RAB11FIP3O75154 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms