Protein–RNA interactions for Protein: O43921

EFNA2, Ephrin-A2, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA2O43921 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EFNA2O43921 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EFNA2O43921 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EFNA2O43921 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EFNA2O43921 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EFNA2O43921 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EFNA2O43921 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
EFNA2O43921 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EFNA2O43921 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EFNA2O43921 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EFNA2O43921 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
EFNA2O43921 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EFNA2O43921 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EFNA2O43921 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EFNA2O43921 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EFNA2O43921 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EFNA2O43921 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
EFNA2O43921 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EFNA2O43921 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EFNA2O43921 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EFNA2O43921 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
EFNA2O43921 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EFNA2O43921 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
EFNA2O43921 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EFNA2O43921 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EFNA2O43921 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EFNA2O43921 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
EFNA2O43921 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
EFNA2O43921 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
EFNA2O43921 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
EFNA2O43921 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
EFNA2O43921 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
EFNA2O43921 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EFNA2O43921 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EFNA2O43921 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
EFNA2O43921 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EFNA2O43921 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
EFNA2O43921 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EFNA2O43921 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
EFNA2O43921 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EFNA2O43921 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EFNA2O43921 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
EFNA2O43921 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
EFNA2O43921 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EFNA2O43921 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EFNA2O43921 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
EFNA2O43921 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
EFNA2O43921 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EFNA2O43921 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EFNA2O43921 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
EFNA2O43921 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EFNA2O43921 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
EFNA2O43921 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EFNA2O43921 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EFNA2O43921 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EFNA2O43921 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EFNA2O43921 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
EFNA2O43921 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
EFNA2O43921 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
EFNA2O43921 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
EFNA2O43921 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
EFNA2O43921 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
EFNA2O43921 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
EFNA2O43921 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
EFNA2O43921 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EFNA2O43921 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EFNA2O43921 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
EFNA2O43921 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EFNA2O43921 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EFNA2O43921 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
EFNA2O43921 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EFNA2O43921 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EFNA2O43921 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
EFNA2O43921 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EFNA2O43921 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
EFNA2O43921 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EFNA2O43921 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EFNA2O43921 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EFNA2O43921 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EFNA2O43921 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EFNA2O43921 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EFNA2O43921 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EFNA2O43921 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EFNA2O43921 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EFNA2O43921 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EFNA2O43921 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EFNA2O43921 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EFNA2O43921 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EFNA2O43921 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EFNA2O43921 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EFNA2O43921 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EFNA2O43921 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
EFNA2O43921 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EFNA2O43921 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
EFNA2O43921 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EFNA2O43921 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EFNA2O43921 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EFNA2O43921 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EFNA2O43921 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EFNA2O43921 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms