Protein–RNA interactions for Protein: O43716

GATC, Glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit C, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATCO43716 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GATCO43716 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GATCO43716 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
GATCO43716 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
GATCO43716 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GATCO43716 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
GATCO43716 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
GATCO43716 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
GATCO43716 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GATCO43716 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GATCO43716 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GATCO43716 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GATCO43716 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GATCO43716 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GATCO43716 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GATCO43716 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GATCO43716 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GATCO43716 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GATCO43716 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GATCO43716 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GATCO43716 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GATCO43716 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GATCO43716 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GATCO43716 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GATCO43716 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GATCO43716 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GATCO43716 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
GATCO43716 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GATCO43716 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GATCO43716 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GATCO43716 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GATCO43716 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GATCO43716 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GATCO43716 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GATCO43716 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GATCO43716 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GATCO43716 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GATCO43716 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GATCO43716 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GATCO43716 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GATCO43716 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GATCO43716 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GATCO43716 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GATCO43716 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GATCO43716 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GATCO43716 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GATCO43716 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GATCO43716 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GATCO43716 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GATCO43716 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GATCO43716 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GATCO43716 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GATCO43716 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GATCO43716 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GATCO43716 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GATCO43716 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GATCO43716 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GATCO43716 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GATCO43716 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GATCO43716 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GATCO43716 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GATCO43716 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GATCO43716 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GATCO43716 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GATCO43716 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GATCO43716 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GATCO43716 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GATCO43716 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GATCO43716 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GATCO43716 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GATCO43716 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GATCO43716 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GATCO43716 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GATCO43716 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GATCO43716 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GATCO43716 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GATCO43716 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GATCO43716 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GATCO43716 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GATCO43716 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GATCO43716 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GATCO43716 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GATCO43716 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GATCO43716 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GATCO43716 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GATCO43716 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GATCO43716 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GATCO43716 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GATCO43716 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GATCO43716 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GATCO43716 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GATCO43716 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GATCO43716 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GATCO43716 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GATCO43716 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GATCO43716 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GATCO43716 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GATCO43716 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GATCO43716 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GATCO43716 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms