Protein–RNA interactions for Protein: O43295

SRGAP3, SLIT-ROBO Rho GTPase-activating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,099 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRGAP3O43295 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SRGAP3O43295 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SRGAP3O43295 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SRGAP3O43295 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SRGAP3O43295 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SRGAP3O43295 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SRGAP3O43295 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SRGAP3O43295 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
SRGAP3O43295 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SRGAP3O43295 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SRGAP3O43295 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SRGAP3O43295 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
SRGAP3O43295 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
SRGAP3O43295 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SRGAP3O43295 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SRGAP3O43295 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SRGAP3O43295 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SRGAP3O43295 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SRGAP3O43295 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SRGAP3O43295 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SRGAP3O43295 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
SRGAP3O43295 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
SRGAP3O43295 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SRGAP3O43295 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SRGAP3O43295 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SRGAP3O43295 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SRGAP3O43295 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SRGAP3O43295 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SRGAP3O43295 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SRGAP3O43295 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SRGAP3O43295 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SRGAP3O43295 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SRGAP3O43295 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SRGAP3O43295 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SRGAP3O43295 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SRGAP3O43295 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SRGAP3O43295 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SRGAP3O43295 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SRGAP3O43295 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SRGAP3O43295 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SRGAP3O43295 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
SRGAP3O43295 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
SRGAP3O43295 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SRGAP3O43295 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SRGAP3O43295 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SRGAP3O43295 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SRGAP3O43295 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SRGAP3O43295 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SRGAP3O43295 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SRGAP3O43295 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SRGAP3O43295 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SRGAP3O43295 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SRGAP3O43295 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SRGAP3O43295 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SRGAP3O43295 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SRGAP3O43295 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SRGAP3O43295 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SRGAP3O43295 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
SRGAP3O43295 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SRGAP3O43295 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SRGAP3O43295 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SRGAP3O43295 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SRGAP3O43295 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SRGAP3O43295 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SRGAP3O43295 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SRGAP3O43295 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SRGAP3O43295 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SRGAP3O43295 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SRGAP3O43295 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SRGAP3O43295 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SRGAP3O43295 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SRGAP3O43295 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SRGAP3O43295 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SRGAP3O43295 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SRGAP3O43295 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
SRGAP3O43295 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SRGAP3O43295 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SRGAP3O43295 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
SRGAP3O43295 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SRGAP3O43295 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SRGAP3O43295 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SRGAP3O43295 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SRGAP3O43295 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SRGAP3O43295 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SRGAP3O43295 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SRGAP3O43295 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SRGAP3O43295 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SRGAP3O43295 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SRGAP3O43295 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SRGAP3O43295 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SRGAP3O43295 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SRGAP3O43295 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SRGAP3O43295 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SRGAP3O43295 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SRGAP3O43295 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SRGAP3O43295 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SRGAP3O43295 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SRGAP3O43295 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SRGAP3O43295 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SRGAP3O43295 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms