Protein–RNA interactions for Protein: O43172

PRPF4, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 522 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4O43172 NAGPA-206ENST00000562746 2260 ntTSL 221.35■■□□□ 1.016e-6■■■■□ 20.1
PRPF4O43172 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.966e-6■■■■□ 20.1
PRPF4O43172 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.916e-6■■■■□ 20.1
PRPF4O43172 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.886e-6■■■■□ 20.1
PRPF4O43172 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.876e-6■■■■□ 20.1
PRPF4O43172 TMED10-207ENST00000622441 612 nt20.44■□□□□ 0.866e-6■■■■□ 20.1
PRPF4O43172 FBLN1-207ENST00000439835 572 ntTSL 420.41■□□□□ 0.866e-6■■■■□ 20.1
PRPF4O43172 BUD23-217ENST00000487006 631 ntTSL 320.39■□□□□ 0.856e-6■■■■□ 20.1
PRPF4O43172 EIF4G1-230ENST00000460829 1804 ntTSL 220.32■□□□□ 0.846e-6■■■■□ 20.1
PRPF4O43172 NOP16-203ENST00000503849 582 ntTSL 220.12■□□□□ 0.816e-6■■■■□ 20.1
PRPF4O43172 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.86e-6■■■■□ 20.1
PRPF4O43172 CHFR-212ENST00000536196 597 ntTSL 420.04■□□□□ 0.86e-6■■■■□ 20.1
PRPF4O43172 CCDC137-204ENST00000574107 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 320■□□□□ 0.795e-6■■■■□ 20.1
PRPF4O43172 CHFR-217ENST00000540537 913 ntTSL 319.97■□□□□ 0.796e-6■■■■□ 20.1
PRPF4O43172 EHMT1-217ENST00000494249 2038 ntTSL 1 (best)19.86■□□□□ 0.776e-6■■■■□ 20.1
PRPF4O43172 NAGPA-207ENST00000563578 1494 ntTSL 319.71■□□□□ 0.756e-6■■■■□ 20.1
PRPF4O43172 MNT-204ENST00000572892 556 ntTSL 419.69■□□□□ 0.746e-6■■■■□ 20.1
PRPF4O43172 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.726e-6■■■■□ 20.1
PRPF4O43172 CHFR-209ENST00000535181 753 ntTSL 219.54■□□□□ 0.726e-6■■■■□ 20.1
PRPF4O43172 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.716e-6■■■■□ 20.1
PRPF4O43172 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.686e-6■■■■□ 20.1
PRPF4O43172 HDGFL2-207ENST00000615225 3100 ntTSL 519.17■□□□□ 0.666e-6■■■■□ 20.1
PRPF4O43172 NAGPA-213ENST00000568202 1843 ntTSL 519.16■□□□□ 0.666e-6■■■■□ 20.1
PRPF4O43172 NELFA-205ENST00000416258 2188 ntTSL 519.08■□□□□ 0.646e-6■■■■□ 20.1
PRPF4O43172 INAVA-207ENST00000532631 570 ntTSL 319.05■□□□□ 0.646e-6■■■■□ 20.1
PRPF4O43172 NAGPA-205ENST00000562346 570 ntTSL 419.03■□□□□ 0.646e-6■■■■□ 20.1
PRPF4O43172 NELFA-201ENST00000333877 2228 ntTSL 219.02■□□□□ 0.646e-6■■■■□ 20.1
PRPF4O43172 EIF4G1-233ENST00000475721 1271 ntTSL 219■□□□□ 0.636e-6■■■■□ 20.1
PRPF4O43172 NAGK-213ENST00000475709 2986 ntTSL 218.91■□□□□ 0.626e-6■■■■□ 20.1
PRPF4O43172 CD27-AS1-205ENST00000535639 2364 ntTSL 218.8■□□□□ 0.66e-6■■■■□ 20.1
PRPF4O43172 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.65e-6■■■■□ 20.1
PRPF4O43172 AMPD2-210ENST00000476688 1111 ntTSL 318.76■□□□□ 0.596e-6■■■■□ 20.1
PRPF4O43172 TRMT2A-211ENST00000468917 957 ntTSL 218.73■□□□□ 0.596e-6■■■■□ 20.1
PRPF4O43172 FBLN1-209ENST00000445110 512 ntTSL 418.66■□□□□ 0.586e-6■■■■□ 20.1
PRPF4O43172 MNT-202ENST00000571232 508 ntTSL 418.64■□□□□ 0.576e-6■■■■□ 20.1
PRPF4O43172 NOC2L-204ENST00000483767 1611 ntTSL 218.59■□□□□ 0.576e-6■■■■□ 20.1
PRPF4O43172 HAAO-206ENST00000406924 1103 ntTSL 218.57■□□□□ 0.566e-6■■■■□ 20.1
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PRPF4O43172 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.556e-6■■■■□ 20.1
PRPF4O43172 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.556e-6■■■■□ 20.1
PRPF4O43172 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.556e-6■■■■□ 20.1
PRPF4O43172 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.556e-6■■■■□ 20.1
PRPF4O43172 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.546e-6■■■■□ 20.1
PRPF4O43172 NAGK-207ENST00000455197 763 ntTSL 518.43■□□□□ 0.546e-6■■■■□ 20.1
PRPF4O43172 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.536e-6■■■■□ 20.1
PRPF4O43172 NELFA-213ENST00000467661 1707 ntTSL 1 (best)18.35■□□□□ 0.536e-6■■■■□ 20.1
PRPF4O43172 BUD23-202ENST00000421304 538 ntTSL 418.3■□□□□ 0.526e-6■■■■□ 20.1
PRPF4O43172 SLC22A7-204ENST00000436107 658 ntTSL 518.3■□□□□ 0.526e-6■■■■□ 20.1
PRPF4O43172 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.526e-6■■■■□ 20.1
PRPF4O43172 PPP5C-206ENST00000486994 2209 ntTSL 218.27■□□□□ 0.526e-6■■■■□ 20.1
PRPF4O43172 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.56e-6■■■■□ 20.1
PRPF4O43172 CD27-AS1-208ENST00000538616 657 ntTSL 218.17■□□□□ 0.56e-6■■■■□ 20.1
PRPF4O43172 BUD23-210ENST00000441822 632 ntTSL 318.14■□□□□ 0.496e-6■■■■□ 20.1
PRPF4O43172 BUD23-206ENST00000430270 1260 ntTSL 518.14■□□□□ 0.496e-6■■■■□ 20.1
PRPF4O43172 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.476e-6■■■■□ 20.1
PRPF4O43172 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.476e-6■■■■□ 20.1
PRPF4O43172 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.476e-6■■■■□ 20.1
PRPF4O43172 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.466e-6■■■■□ 20.1
PRPF4O43172 BUD23-203ENST00000421744 895 ntTSL 217.9■□□□□ 0.466e-6■■■■□ 20.1
PRPF4O43172 BUD23-208ENST00000432522 1074 ntTSL 217.89■□□□□ 0.456e-6■■■■□ 20.1
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PRPF4O43172 BUD23-218ENST00000496153 505 ntTSL 417.86■□□□□ 0.456e-6■■■■□ 20.1
PRPF4O43172 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.456e-6■■■■□ 20.1
PRPF4O43172 BUD23-216ENST00000478670 572 ntTSL 417.86■□□□□ 0.456e-6■■■■□ 20.1
PRPF4O43172 NAGK-206ENST00000450272 1833 ntTSL 517.79■□□□□ 0.446e-6■■■■□ 20.1
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PRPF4O43172 DDX41-201ENST00000330503 2137 ntTSL 1 (best)17.37■□□□□ 0.376e-6■■■■□ 20.1
PRPF4O43172 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.376e-6■■■■□ 20.1
PRPF4O43172 FBLN1-213ENST00000455233 671 ntTSL 317.34■□□□□ 0.376e-6■■■■□ 20.1
PRPF4O43172 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.366e-6■■■■□ 20.1
PRPF4O43172 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.356e-6■■■■□ 20.1
PRPF4O43172 EHMT1-248ENST00000637891 1930 ntTSL 517.24■□□□□ 0.356e-6■■■■□ 20.1
PRPF4O43172 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.356e-6■■■■□ 20.1
PRPF4O43172 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.346e-6■■■■□ 20.1
PRPF4O43172 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.346e-6■■■■□ 20.1
PRPF4O43172 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.336e-6■■■■□ 20.1
PRPF4O43172 HAAO-203ENST00000402698 1522 ntTSL 517.1■□□□□ 0.336e-6■■■■□ 20.1
PRPF4O43172 NAGK-228ENST00000533981 776 ntTSL 317.06■□□□□ 0.326e-6■■■■□ 20.1
PRPF4O43172 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.316e-6■■■■□ 20.1
PRPF4O43172 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.36e-6■■■■□ 20.1
PRPF4O43172 BUD23-214ENST00000464615 458 ntTSL 516.9■□□□□ 0.36e-6■■■■□ 20.1
PRPF4O43172 DDX41-205ENST00000505081 2949 ntTSL 216.86■□□□□ 0.296e-6■■■■□ 20.1
PRPF4O43172 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.286e-6■■■■□ 20.1
PRPF4O43172 DGCR8-205ENST00000475941 2669 ntTSL 216.76■□□□□ 0.276e-6■■■■□ 20.1
PRPF4O43172 HAAO-202ENST00000402268 908 ntTSL 216.71■□□□□ 0.276e-6■■■■□ 20.1
PRPF4O43172 DDX41-217ENST00000515562 1184 ntTSL 1 (best)16.69■□□□□ 0.266e-6■■■■□ 20.1
PRPF4O43172 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.266e-6■■■■□ 20.1
PRPF4O43172 ZFP30-206ENST00000587199 557 ntTSL 416.63■□□□□ 0.256e-6■■■■□ 20.1
PRPF4O43172 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.246e-6■■■■□ 20.1
PRPF4O43172 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.246e-6■■■■□ 20.1
PRPF4O43172 PHF8-207ENST00000415025 687 ntTSL 316.51■□□□□ 0.236e-6■■■■□ 20.1
PRPF4O43172 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.196e-6■■■■□ 20.1
PRPF4O43172 NAGPA-215ENST00000569296 866 ntTSL 516.23■□□□□ 0.196e-6■■■■□ 20.1
PRPF4O43172 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.186e-6■■■■□ 20.1
PRPF4O43172 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.176e-6■■■■□ 20.1
PRPF4O43172 PPP5C-203ENST00000467502 1235 ntTSL 216.09■□□□□ 0.176e-6■■■■□ 20.1
PRPF4O43172 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.156e-6■■■■□ 20.1
PRPF4O43172 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.126e-6■■■■□ 20.1
PRPF4O43172 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.126e-6■■■■□ 20.1
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