Protein–RNA interactions for Protein: O15084

ANKRD28, Serine/threonine-protein phosphatase 6 regulatory ankyrin repeat subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28O15084 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ANKRD28O15084 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ANKRD28O15084 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ANKRD28O15084 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ANKRD28O15084 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ANKRD28O15084 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ANKRD28O15084 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ANKRD28O15084 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ANKRD28O15084 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ANKRD28O15084 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
ANKRD28O15084 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ANKRD28O15084 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ANKRD28O15084 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
ANKRD28O15084 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
ANKRD28O15084 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ANKRD28O15084 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ANKRD28O15084 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ANKRD28O15084 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ANKRD28O15084 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ANKRD28O15084 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ANKRD28O15084 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ANKRD28O15084 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ANKRD28O15084 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ANKRD28O15084 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ANKRD28O15084 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ANKRD28O15084 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
ANKRD28O15084 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ANKRD28O15084 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ANKRD28O15084 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ANKRD28O15084 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ANKRD28O15084 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ANKRD28O15084 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ANKRD28O15084 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ANKRD28O15084 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ANKRD28O15084 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ANKRD28O15084 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ANKRD28O15084 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ANKRD28O15084 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ANKRD28O15084 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
ANKRD28O15084 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ANKRD28O15084 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ANKRD28O15084 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ANKRD28O15084 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ANKRD28O15084 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ANKRD28O15084 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ANKRD28O15084 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ANKRD28O15084 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ANKRD28O15084 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ANKRD28O15084 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ANKRD28O15084 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
ANKRD28O15084 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ANKRD28O15084 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ANKRD28O15084 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ANKRD28O15084 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ANKRD28O15084 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ANKRD28O15084 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ANKRD28O15084 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ANKRD28O15084 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ANKRD28O15084 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
ANKRD28O15084 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ANKRD28O15084 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ANKRD28O15084 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ANKRD28O15084 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ANKRD28O15084 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
ANKRD28O15084 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ANKRD28O15084 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ANKRD28O15084 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ANKRD28O15084 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ANKRD28O15084 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ANKRD28O15084 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ANKRD28O15084 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ANKRD28O15084 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ANKRD28O15084 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ANKRD28O15084 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ANKRD28O15084 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ANKRD28O15084 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
ANKRD28O15084 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
ANKRD28O15084 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ANKRD28O15084 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ANKRD28O15084 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ANKRD28O15084 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ANKRD28O15084 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ANKRD28O15084 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ANKRD28O15084 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ANKRD28O15084 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ANKRD28O15084 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ANKRD28O15084 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ANKRD28O15084 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ANKRD28O15084 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ANKRD28O15084 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ANKRD28O15084 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ANKRD28O15084 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ANKRD28O15084 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ANKRD28O15084 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ANKRD28O15084 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ANKRD28O15084 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ANKRD28O15084 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ANKRD28O15084 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ANKRD28O15084 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ANKRD28O15084 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms