Protein–RNA interactions for Protein: O00221

NFKBIE, NF-kappa-B inhibitor epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIEO00221 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NFKBIEO00221 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NFKBIEO00221 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NFKBIEO00221 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NFKBIEO00221 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NFKBIEO00221 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NFKBIEO00221 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NFKBIEO00221 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NFKBIEO00221 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NFKBIEO00221 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NFKBIEO00221 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NFKBIEO00221 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NFKBIEO00221 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NFKBIEO00221 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
NFKBIEO00221 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NFKBIEO00221 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NFKBIEO00221 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NFKBIEO00221 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NFKBIEO00221 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
NFKBIEO00221 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NFKBIEO00221 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
NFKBIEO00221 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
NFKBIEO00221 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
NFKBIEO00221 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NFKBIEO00221 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
NFKBIEO00221 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
NFKBIEO00221 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NFKBIEO00221 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NFKBIEO00221 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NFKBIEO00221 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NFKBIEO00221 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NFKBIEO00221 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NFKBIEO00221 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NFKBIEO00221 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NFKBIEO00221 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NFKBIEO00221 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NFKBIEO00221 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NFKBIEO00221 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NFKBIEO00221 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NFKBIEO00221 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NFKBIEO00221 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NFKBIEO00221 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NFKBIEO00221 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NFKBIEO00221 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NFKBIEO00221 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NFKBIEO00221 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NFKBIEO00221 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NFKBIEO00221 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
NFKBIEO00221 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NFKBIEO00221 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NFKBIEO00221 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NFKBIEO00221 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NFKBIEO00221 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NFKBIEO00221 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NFKBIEO00221 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NFKBIEO00221 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NFKBIEO00221 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NFKBIEO00221 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NFKBIEO00221 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NFKBIEO00221 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
NFKBIEO00221 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NFKBIEO00221 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NFKBIEO00221 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NFKBIEO00221 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NFKBIEO00221 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
NFKBIEO00221 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NFKBIEO00221 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
NFKBIEO00221 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
NFKBIEO00221 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NFKBIEO00221 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NFKBIEO00221 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NFKBIEO00221 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NFKBIEO00221 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NFKBIEO00221 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NFKBIEO00221 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NFKBIEO00221 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NFKBIEO00221 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NFKBIEO00221 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NFKBIEO00221 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NFKBIEO00221 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
NFKBIEO00221 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NFKBIEO00221 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NFKBIEO00221 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NFKBIEO00221 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NFKBIEO00221 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NFKBIEO00221 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NFKBIEO00221 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NFKBIEO00221 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NFKBIEO00221 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NFKBIEO00221 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NFKBIEO00221 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NFKBIEO00221 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NFKBIEO00221 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NFKBIEO00221 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NFKBIEO00221 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NFKBIEO00221 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
NFKBIEO00221 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NFKBIEO00221 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NFKBIEO00221 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NFKBIEO00221 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms