Protein–RNA interactions for Protein: H3BVE0

BOLA2-SMG1P6, BOLA2-SMG1P6 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms