Protein–RNA interactions for Protein: C9JVI0

USP17L11, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L11C9JVI0 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP17L11C9JVI0 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP17L11C9JVI0 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
USP17L11C9JVI0 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP17L11C9JVI0 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP17L11C9JVI0 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP17L11C9JVI0 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP17L11C9JVI0 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP17L11C9JVI0 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
USP17L11C9JVI0 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP17L11C9JVI0 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP17L11C9JVI0 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP17L11C9JVI0 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP17L11C9JVI0 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP17L11C9JVI0 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP17L11C9JVI0 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP17L11C9JVI0 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP17L11C9JVI0 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP17L11C9JVI0 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP17L11C9JVI0 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP17L11C9JVI0 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP17L11C9JVI0 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP17L11C9JVI0 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP17L11C9JVI0 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP17L11C9JVI0 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP17L11C9JVI0 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP17L11C9JVI0 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP17L11C9JVI0 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP17L11C9JVI0 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP17L11C9JVI0 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP17L11C9JVI0 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP17L11C9JVI0 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP17L11C9JVI0 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP17L11C9JVI0 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP17L11C9JVI0 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP17L11C9JVI0 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP17L11C9JVI0 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP17L11C9JVI0 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP17L11C9JVI0 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP17L11C9JVI0 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP17L11C9JVI0 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP17L11C9JVI0 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP17L11C9JVI0 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP17L11C9JVI0 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
USP17L11C9JVI0 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
USP17L11C9JVI0 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
USP17L11C9JVI0 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
USP17L11C9JVI0 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
USP17L11C9JVI0 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
USP17L11C9JVI0 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
USP17L11C9JVI0 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
USP17L11C9JVI0 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
USP17L11C9JVI0 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
USP17L11C9JVI0 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
USP17L11C9JVI0 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
USP17L11C9JVI0 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
USP17L11C9JVI0 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
USP17L11C9JVI0 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
USP17L11C9JVI0 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
USP17L11C9JVI0 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
USP17L11C9JVI0 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
USP17L11C9JVI0 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
USP17L11C9JVI0 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
USP17L11C9JVI0 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
USP17L11C9JVI0 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
USP17L11C9JVI0 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
USP17L11C9JVI0 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
USP17L11C9JVI0 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
USP17L11C9JVI0 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
USP17L11C9JVI0 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
USP17L11C9JVI0 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
USP17L11C9JVI0 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
USP17L11C9JVI0 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
USP17L11C9JVI0 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
USP17L11C9JVI0 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
USP17L11C9JVI0 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
USP17L11C9JVI0 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
USP17L11C9JVI0 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
USP17L11C9JVI0 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
USP17L11C9JVI0 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
USP17L11C9JVI0 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
USP17L11C9JVI0 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
USP17L11C9JVI0 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
USP17L11C9JVI0 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
USP17L11C9JVI0 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
USP17L11C9JVI0 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
USP17L11C9JVI0 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
USP17L11C9JVI0 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
USP17L11C9JVI0 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
USP17L11C9JVI0 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
USP17L11C9JVI0 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
USP17L11C9JVI0 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
USP17L11C9JVI0 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
USP17L11C9JVI0 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
USP17L11C9JVI0 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
USP17L11C9JVI0 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
USP17L11C9JVI0 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
USP17L11C9JVI0 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
USP17L11C9JVI0 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
USP17L11C9JVI0 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms