Protein–RNA interactions for Protein: C9JH25

PRRT4, Proline-rich transmembrane protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 899 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRT4C9JH25 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PRRT4C9JH25 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PRRT4C9JH25 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PRRT4C9JH25 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PRRT4C9JH25 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PRRT4C9JH25 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PRRT4C9JH25 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PRRT4C9JH25 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PRRT4C9JH25 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PRRT4C9JH25 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
PRRT4C9JH25 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
PRRT4C9JH25 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PRRT4C9JH25 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PRRT4C9JH25 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PRRT4C9JH25 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PRRT4C9JH25 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PRRT4C9JH25 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
PRRT4C9JH25 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PRRT4C9JH25 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PRRT4C9JH25 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PRRT4C9JH25 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PRRT4C9JH25 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PRRT4C9JH25 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PRRT4C9JH25 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PRRT4C9JH25 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PRRT4C9JH25 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRRT4C9JH25 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRRT4C9JH25 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRRT4C9JH25 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRRT4C9JH25 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRRT4C9JH25 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRRT4C9JH25 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRRT4C9JH25 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRRT4C9JH25 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
PRRT4C9JH25 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRRT4C9JH25 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRRT4C9JH25 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRRT4C9JH25 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRRT4C9JH25 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRRT4C9JH25 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRRT4C9JH25 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRRT4C9JH25 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRRT4C9JH25 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRRT4C9JH25 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRRT4C9JH25 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRRT4C9JH25 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRRT4C9JH25 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
PRRT4C9JH25 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRRT4C9JH25 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
PRRT4C9JH25 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRRT4C9JH25 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRRT4C9JH25 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRRT4C9JH25 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRRT4C9JH25 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRRT4C9JH25 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRRT4C9JH25 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRRT4C9JH25 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRRT4C9JH25 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRRT4C9JH25 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRRT4C9JH25 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRRT4C9JH25 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PRRT4C9JH25 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PRRT4C9JH25 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PRRT4C9JH25 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PRRT4C9JH25 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
PRRT4C9JH25 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PRRT4C9JH25 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PRRT4C9JH25 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
PRRT4C9JH25 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PRRT4C9JH25 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PRRT4C9JH25 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PRRT4C9JH25 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PRRT4C9JH25 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
PRRT4C9JH25 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PRRT4C9JH25 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PRRT4C9JH25 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PRRT4C9JH25 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PRRT4C9JH25 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PRRT4C9JH25 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PRRT4C9JH25 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PRRT4C9JH25 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PRRT4C9JH25 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PRRT4C9JH25 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PRRT4C9JH25 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PRRT4C9JH25 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PRRT4C9JH25 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PRRT4C9JH25 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PRRT4C9JH25 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PRRT4C9JH25 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PRRT4C9JH25 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PRRT4C9JH25 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PRRT4C9JH25 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PRRT4C9JH25 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PRRT4C9JH25 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
PRRT4C9JH25 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PRRT4C9JH25 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PRRT4C9JH25 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PRRT4C9JH25 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PRRT4C9JH25 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PRRT4C9JH25 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms