Protein–RNA interactions for Protein: C9JE40

PATL2, Protein PAT1 homolog 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PATL2C9JE40 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PATL2C9JE40 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PATL2C9JE40 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PATL2C9JE40 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PATL2C9JE40 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PATL2C9JE40 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PATL2C9JE40 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PATL2C9JE40 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PATL2C9JE40 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PATL2C9JE40 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PATL2C9JE40 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PATL2C9JE40 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PATL2C9JE40 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
PATL2C9JE40 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PATL2C9JE40 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PATL2C9JE40 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PATL2C9JE40 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PATL2C9JE40 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PATL2C9JE40 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PATL2C9JE40 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PATL2C9JE40 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PATL2C9JE40 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PATL2C9JE40 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PATL2C9JE40 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PATL2C9JE40 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PATL2C9JE40 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PATL2C9JE40 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PATL2C9JE40 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PATL2C9JE40 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PATL2C9JE40 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PATL2C9JE40 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PATL2C9JE40 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PATL2C9JE40 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PATL2C9JE40 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PATL2C9JE40 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PATL2C9JE40 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PATL2C9JE40 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PATL2C9JE40 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PATL2C9JE40 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PATL2C9JE40 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PATL2C9JE40 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PATL2C9JE40 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PATL2C9JE40 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PATL2C9JE40 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PATL2C9JE40 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PATL2C9JE40 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PATL2C9JE40 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PATL2C9JE40 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PATL2C9JE40 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PATL2C9JE40 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PATL2C9JE40 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PATL2C9JE40 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PATL2C9JE40 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PATL2C9JE40 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PATL2C9JE40 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PATL2C9JE40 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PATL2C9JE40 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PATL2C9JE40 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PATL2C9JE40 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PATL2C9JE40 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PATL2C9JE40 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PATL2C9JE40 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PATL2C9JE40 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
PATL2C9JE40 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
PATL2C9JE40 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
PATL2C9JE40 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PATL2C9JE40 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PATL2C9JE40 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PATL2C9JE40 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PATL2C9JE40 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PATL2C9JE40 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PATL2C9JE40 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PATL2C9JE40 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PATL2C9JE40 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PATL2C9JE40 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
PATL2C9JE40 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
PATL2C9JE40 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PATL2C9JE40 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PATL2C9JE40 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PATL2C9JE40 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PATL2C9JE40 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PATL2C9JE40 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PATL2C9JE40 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PATL2C9JE40 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PATL2C9JE40 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PATL2C9JE40 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PATL2C9JE40 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PATL2C9JE40 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PATL2C9JE40 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PATL2C9JE40 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PATL2C9JE40 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PATL2C9JE40 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PATL2C9JE40 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PATL2C9JE40 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
PATL2C9JE40 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PATL2C9JE40 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PATL2C9JE40 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PATL2C9JE40 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PATL2C9JE40 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PATL2C9JE40 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms