Protein–RNA interactions for Protein: A6NKT7

RGPD3, RanBP2-like and GRIP domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD3A6NKT7 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RGPD3A6NKT7 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RGPD3A6NKT7 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RGPD3A6NKT7 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RGPD3A6NKT7 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RGPD3A6NKT7 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
RGPD3A6NKT7 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
RGPD3A6NKT7 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RGPD3A6NKT7 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RGPD3A6NKT7 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RGPD3A6NKT7 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RGPD3A6NKT7 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RGPD3A6NKT7 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RGPD3A6NKT7 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
RGPD3A6NKT7 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RGPD3A6NKT7 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RGPD3A6NKT7 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RGPD3A6NKT7 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RGPD3A6NKT7 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RGPD3A6NKT7 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RGPD3A6NKT7 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RGPD3A6NKT7 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RGPD3A6NKT7 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RGPD3A6NKT7 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RGPD3A6NKT7 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RGPD3A6NKT7 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RGPD3A6NKT7 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RGPD3A6NKT7 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RGPD3A6NKT7 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RGPD3A6NKT7 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RGPD3A6NKT7 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RGPD3A6NKT7 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RGPD3A6NKT7 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RGPD3A6NKT7 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RGPD3A6NKT7 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
RGPD3A6NKT7 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RGPD3A6NKT7 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
RGPD3A6NKT7 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RGPD3A6NKT7 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RGPD3A6NKT7 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
RGPD3A6NKT7 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RGPD3A6NKT7 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RGPD3A6NKT7 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RGPD3A6NKT7 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RGPD3A6NKT7 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RGPD3A6NKT7 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RGPD3A6NKT7 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RGPD3A6NKT7 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RGPD3A6NKT7 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RGPD3A6NKT7 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RGPD3A6NKT7 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RGPD3A6NKT7 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RGPD3A6NKT7 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RGPD3A6NKT7 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RGPD3A6NKT7 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RGPD3A6NKT7 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
RGPD3A6NKT7 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RGPD3A6NKT7 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RGPD3A6NKT7 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RGPD3A6NKT7 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RGPD3A6NKT7 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RGPD3A6NKT7 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RGPD3A6NKT7 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RGPD3A6NKT7 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RGPD3A6NKT7 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RGPD3A6NKT7 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
RGPD3A6NKT7 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RGPD3A6NKT7 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
RGPD3A6NKT7 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
RGPD3A6NKT7 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RGPD3A6NKT7 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RGPD3A6NKT7 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RGPD3A6NKT7 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RGPD3A6NKT7 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RGPD3A6NKT7 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RGPD3A6NKT7 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RGPD3A6NKT7 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RGPD3A6NKT7 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RGPD3A6NKT7 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
RGPD3A6NKT7 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RGPD3A6NKT7 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
RGPD3A6NKT7 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
RGPD3A6NKT7 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RGPD3A6NKT7 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RGPD3A6NKT7 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RGPD3A6NKT7 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
RGPD3A6NKT7 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RGPD3A6NKT7 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RGPD3A6NKT7 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RGPD3A6NKT7 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RGPD3A6NKT7 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RGPD3A6NKT7 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
RGPD3A6NKT7 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RGPD3A6NKT7 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RGPD3A6NKT7 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RGPD3A6NKT7 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RGPD3A6NKT7 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RGPD3A6NKT7 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
RGPD3A6NKT7 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
RGPD3A6NKT7 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms