Protein–RNA interactions for Protein: A6NDB9

PALM3, Paralemmin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 673 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALM3A6NDB9 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PALM3A6NDB9 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PALM3A6NDB9 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PALM3A6NDB9 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PALM3A6NDB9 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PALM3A6NDB9 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PALM3A6NDB9 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PALM3A6NDB9 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PALM3A6NDB9 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PALM3A6NDB9 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PALM3A6NDB9 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PALM3A6NDB9 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PALM3A6NDB9 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PALM3A6NDB9 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PALM3A6NDB9 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PALM3A6NDB9 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PALM3A6NDB9 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PALM3A6NDB9 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PALM3A6NDB9 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PALM3A6NDB9 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PALM3A6NDB9 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PALM3A6NDB9 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PALM3A6NDB9 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PALM3A6NDB9 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PALM3A6NDB9 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PALM3A6NDB9 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PALM3A6NDB9 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PALM3A6NDB9 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PALM3A6NDB9 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PALM3A6NDB9 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PALM3A6NDB9 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PALM3A6NDB9 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PALM3A6NDB9 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PALM3A6NDB9 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PALM3A6NDB9 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PALM3A6NDB9 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PALM3A6NDB9 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PALM3A6NDB9 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PALM3A6NDB9 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PALM3A6NDB9 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PALM3A6NDB9 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PALM3A6NDB9 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PALM3A6NDB9 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PALM3A6NDB9 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PALM3A6NDB9 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PALM3A6NDB9 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PALM3A6NDB9 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PALM3A6NDB9 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PALM3A6NDB9 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PALM3A6NDB9 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PALM3A6NDB9 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PALM3A6NDB9 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PALM3A6NDB9 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PALM3A6NDB9 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PALM3A6NDB9 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PALM3A6NDB9 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PALM3A6NDB9 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PALM3A6NDB9 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PALM3A6NDB9 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PALM3A6NDB9 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PALM3A6NDB9 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PALM3A6NDB9 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PALM3A6NDB9 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PALM3A6NDB9 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PALM3A6NDB9 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PALM3A6NDB9 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PALM3A6NDB9 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PALM3A6NDB9 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PALM3A6NDB9 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PALM3A6NDB9 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PALM3A6NDB9 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PALM3A6NDB9 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PALM3A6NDB9 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PALM3A6NDB9 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PALM3A6NDB9 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PALM3A6NDB9 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PALM3A6NDB9 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PALM3A6NDB9 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PALM3A6NDB9 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PALM3A6NDB9 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PALM3A6NDB9 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PALM3A6NDB9 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PALM3A6NDB9 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PALM3A6NDB9 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PALM3A6NDB9 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PALM3A6NDB9 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PALM3A6NDB9 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PALM3A6NDB9 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PALM3A6NDB9 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PALM3A6NDB9 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PALM3A6NDB9 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PALM3A6NDB9 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PALM3A6NDB9 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PALM3A6NDB9 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PALM3A6NDB9 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PALM3A6NDB9 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PALM3A6NDB9 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PALM3A6NDB9 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PALM3A6NDB9 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PALM3A6NDB9 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms