Protein–RNA interactions for Protein: A3QJZ6

PRAMEF22, PRAME family member 22, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF22A3QJZ6 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
PRAMEF22A3QJZ6 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PRAMEF22A3QJZ6 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PRAMEF22A3QJZ6 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PRAMEF22A3QJZ6 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PRAMEF22A3QJZ6 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PRAMEF22A3QJZ6 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PRAMEF22A3QJZ6 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PRAMEF22A3QJZ6 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PRAMEF22A3QJZ6 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PRAMEF22A3QJZ6 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PRAMEF22A3QJZ6 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRAMEF22A3QJZ6 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRAMEF22A3QJZ6 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRAMEF22A3QJZ6 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRAMEF22A3QJZ6 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRAMEF22A3QJZ6 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRAMEF22A3QJZ6 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRAMEF22A3QJZ6 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRAMEF22A3QJZ6 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRAMEF22A3QJZ6 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRAMEF22A3QJZ6 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRAMEF22A3QJZ6 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRAMEF22A3QJZ6 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRAMEF22A3QJZ6 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRAMEF22A3QJZ6 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRAMEF22A3QJZ6 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRAMEF22A3QJZ6 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRAMEF22A3QJZ6 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRAMEF22A3QJZ6 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRAMEF22A3QJZ6 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PRAMEF22A3QJZ6 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PRAMEF22A3QJZ6 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PRAMEF22A3QJZ6 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PRAMEF22A3QJZ6 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
PRAMEF22A3QJZ6 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PRAMEF22A3QJZ6 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PRAMEF22A3QJZ6 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PRAMEF22A3QJZ6 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PRAMEF22A3QJZ6 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PRAMEF22A3QJZ6 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PRAMEF22A3QJZ6 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PRAMEF22A3QJZ6 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PRAMEF22A3QJZ6 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PRAMEF22A3QJZ6 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PRAMEF22A3QJZ6 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PRAMEF22A3QJZ6 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PRAMEF22A3QJZ6 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRAMEF22A3QJZ6 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRAMEF22A3QJZ6 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRAMEF22A3QJZ6 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRAMEF22A3QJZ6 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRAMEF22A3QJZ6 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRAMEF22A3QJZ6 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRAMEF22A3QJZ6 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRAMEF22A3QJZ6 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRAMEF22A3QJZ6 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRAMEF22A3QJZ6 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRAMEF22A3QJZ6 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRAMEF22A3QJZ6 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRAMEF22A3QJZ6 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRAMEF22A3QJZ6 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRAMEF22A3QJZ6 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRAMEF22A3QJZ6 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
PRAMEF22A3QJZ6 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PRAMEF22A3QJZ6 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PRAMEF22A3QJZ6 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PRAMEF22A3QJZ6 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PRAMEF22A3QJZ6 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PRAMEF22A3QJZ6 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PRAMEF22A3QJZ6 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PRAMEF22A3QJZ6 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
PRAMEF22A3QJZ6 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PRAMEF22A3QJZ6 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
PRAMEF22A3QJZ6 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PRAMEF22A3QJZ6 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
PRAMEF22A3QJZ6 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PRAMEF22A3QJZ6 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRAMEF22A3QJZ6 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRAMEF22A3QJZ6 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRAMEF22A3QJZ6 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRAMEF22A3QJZ6 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRAMEF22A3QJZ6 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
PRAMEF22A3QJZ6 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRAMEF22A3QJZ6 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRAMEF22A3QJZ6 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRAMEF22A3QJZ6 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRAMEF22A3QJZ6 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRAMEF22A3QJZ6 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRAMEF22A3QJZ6 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRAMEF22A3QJZ6 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRAMEF22A3QJZ6 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRAMEF22A3QJZ6 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRAMEF22A3QJZ6 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRAMEF22A3QJZ6 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRAMEF22A3QJZ6 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
PRAMEF22A3QJZ6 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRAMEF22A3QJZ6 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRAMEF22A3QJZ6 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
PRAMEF22A3QJZ6 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms