Protein–RNA interactions for Protein: A2A2Y4

FRMD3, FERM domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMD3A2A2Y4 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FRMD3A2A2Y4 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FRMD3A2A2Y4 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FRMD3A2A2Y4 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FRMD3A2A2Y4 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FRMD3A2A2Y4 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FRMD3A2A2Y4 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FRMD3A2A2Y4 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FRMD3A2A2Y4 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FRMD3A2A2Y4 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FRMD3A2A2Y4 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FRMD3A2A2Y4 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
FRMD3A2A2Y4 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FRMD3A2A2Y4 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
FRMD3A2A2Y4 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FRMD3A2A2Y4 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FRMD3A2A2Y4 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FRMD3A2A2Y4 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
FRMD3A2A2Y4 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FRMD3A2A2Y4 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FRMD3A2A2Y4 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
FRMD3A2A2Y4 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FRMD3A2A2Y4 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FRMD3A2A2Y4 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FRMD3A2A2Y4 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FRMD3A2A2Y4 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FRMD3A2A2Y4 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FRMD3A2A2Y4 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FRMD3A2A2Y4 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FRMD3A2A2Y4 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FRMD3A2A2Y4 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FRMD3A2A2Y4 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FRMD3A2A2Y4 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FRMD3A2A2Y4 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FRMD3A2A2Y4 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FRMD3A2A2Y4 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
FRMD3A2A2Y4 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FRMD3A2A2Y4 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FRMD3A2A2Y4 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
FRMD3A2A2Y4 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
FRMD3A2A2Y4 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
FRMD3A2A2Y4 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
FRMD3A2A2Y4 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FRMD3A2A2Y4 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FRMD3A2A2Y4 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FRMD3A2A2Y4 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FRMD3A2A2Y4 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FRMD3A2A2Y4 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FRMD3A2A2Y4 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FRMD3A2A2Y4 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FRMD3A2A2Y4 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FRMD3A2A2Y4 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FRMD3A2A2Y4 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FRMD3A2A2Y4 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FRMD3A2A2Y4 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FRMD3A2A2Y4 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
FRMD3A2A2Y4 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
FRMD3A2A2Y4 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FRMD3A2A2Y4 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FRMD3A2A2Y4 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
FRMD3A2A2Y4 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FRMD3A2A2Y4 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FRMD3A2A2Y4 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FRMD3A2A2Y4 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
FRMD3A2A2Y4 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FRMD3A2A2Y4 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FRMD3A2A2Y4 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FRMD3A2A2Y4 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FRMD3A2A2Y4 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
FRMD3A2A2Y4 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FRMD3A2A2Y4 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FRMD3A2A2Y4 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FRMD3A2A2Y4 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FRMD3A2A2Y4 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FRMD3A2A2Y4 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FRMD3A2A2Y4 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FRMD3A2A2Y4 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FRMD3A2A2Y4 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FRMD3A2A2Y4 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FRMD3A2A2Y4 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FRMD3A2A2Y4 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FRMD3A2A2Y4 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FRMD3A2A2Y4 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FRMD3A2A2Y4 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FRMD3A2A2Y4 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FRMD3A2A2Y4 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FRMD3A2A2Y4 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FRMD3A2A2Y4 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FRMD3A2A2Y4 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FRMD3A2A2Y4 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FRMD3A2A2Y4 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FRMD3A2A2Y4 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FRMD3A2A2Y4 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FRMD3A2A2Y4 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FRMD3A2A2Y4 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
FRMD3A2A2Y4 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FRMD3A2A2Y4 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
FRMD3A2A2Y4 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
FRMD3A2A2Y4 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FRMD3A2A2Y4 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms