Protein–RNA interactions for Protein: Q16654

PDK4, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 4, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK4Q16654 SMAD1-202ENST00000394092 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
PDK4Q16654 OGT-202ENST00000373719 5461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
PDK4Q16654 SLC26A5-206ENST00000393727 2270 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
PDK4Q16654 CDC40-203ENST00000368932 3933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
PDK4Q16654 AC121758.1-201ENST00000557452 3942 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
PDK4Q16654 OR2F1-203ENST00000641412 4829 ntAPPRIS P1 BASIC7.48□□□□□ -1.21
PDK4Q16654 GAS2-201ENST00000278187 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
PDK4Q16654 AC068138.1-201ENST00000412635 217 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
PDK4Q16654 AL451048.1-201ENST00000413328 217 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
PDK4Q16654 AC002367.1-201ENST00000416765 405 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
PDK4Q16654 AC012513.1-201ENST00000417481 784 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
PDK4Q16654 AC011753.4-201ENST00000417974 311 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
PDK4Q16654 AP001595.1-201ENST00000435878 516 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
PDK4Q16654 CICP10-201ENST00000439497 198 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
PDK4Q16654 ZNF559-ZNF177-202ENST00000446085 2470 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
PDK4Q16654 AL590490.1-201ENST00000455599 316 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
PDK4Q16654 GGTA1P-204ENST00000488429 1104 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
PDK4Q16654 RN7SKP105-201ENST00000517192 314 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
PDK4Q16654 RNF145-205ENST00000518802 2603 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
PDK4Q16654 AC084026.2-201ENST00000521101 642 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
PDK4Q16654 OSTCP1-202ENST00000522287 1195 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
PDK4Q16654 IGLVI-70-201ENST00000523272 390 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
PDK4Q16654 IGKV2OR22-4-201ENST00000523309 367 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
PDK4Q16654 AP003122.2-201ENST00000527332 486 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
PDK4Q16654 CCDC58P5-201ENST00000536923 432 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
PDK4Q16654 AC084816.1-211ENST00000540994 485 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
PDK4Q16654 AC055736.1-201ENST00000548135 629 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
PDK4Q16654 LINC02325-203ENST00000554862 733 ntTSL 4 BASIC7.48□□□□□ -1.21
PDK4Q16654 AC092757.2-201ENST00000559026 633 ntTSL 4 BASIC7.48□□□□□ -1.21
PDK4Q16654 CLTC-210ENST00000579456 2301 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
PDK4Q16654 LINC00674-202ENST00000590734 160 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
PDK4Q16654 NUTM2B-AS1-209ENST00000596088 366 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
PDK4Q16654 AC108861.1-201ENST00000611634 585 ntTSL 4 BASIC7.48□□□□□ -1.21
PDK4Q16654 FAM184A-213ENST00000617072 1251 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
PDK4Q16654 AC024475.4-201ENST00000635144 1206 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
PDK4Q16654 KLF7-201ENST00000309446 8362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
PDK4Q16654 LINC01128-205ENST00000445118 6606 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
PDK4Q16654 PPFIA2-205ENST00000541570 2976 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
PDK4Q16654 AC061975.7-201ENST00000592016 2692 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
PDK4Q16654 AL589993.1-201ENST00000407450 2524 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
PDK4Q16654 ZSCAN16-201ENST00000340487 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
PDK4Q16654 C15orf41-214ENST00000569302 1325 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
PDK4Q16654 PIRT-201ENST00000580256 3810 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
PDK4Q16654 LINC01903-201ENST00000580659 2149 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
PDK4Q16654 TTC8-217ENST00000622513 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
PDK4Q16654 SH3D19-210ENST00000514152 5107 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
PDK4Q16654 SOD2-211ENST00000538183 14266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
PDK4Q16654 GREM1-203ENST00000622074 14606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
PDK4Q16654 HTR2A-203ENST00000543956 4689 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
PDK4Q16654 EPYC-201ENST00000261172 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
PDK4Q16654 LRRC31-202ENST00000316428 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
PDK4Q16654 ZNF812P-202ENST00000536819 1890 ntTSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
PDK4Q16654 KIAA0232-202ENST00000425103 7771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
PDK4Q16654 KIAA1210-201ENST00000402510 7824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
PDK4Q16654 NRCAM-204ENST00000379028 6685 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
PDK4Q16654 LINC01630-208ENST00000635680 4363 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
PDK4Q16654 EPHA3-203ENST00000494014 3085 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
PDK4Q16654 GARNL3-205ENST00000435213 3599 ntTSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
PDK4Q16654 AL139805.2-201ENST00000455305 2433 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
PDK4Q16654 C12orf77-202ENST00000549262 1443 ntTSL 4 BASIC7.47□□□□□ -1.21
PDK4Q16654 VTCN1-201ENST00000328189 2289 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
PDK4Q16654 OR1K1-201ENST00000277309 951 ntAPPRIS P1 BASIC7.47□□□□□ -1.21
PDK4Q16654 NDUFA4-201ENST00000339600 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
PDK4Q16654 C9orf92-202ENST00000380685 379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
PDK4Q16654 TERF1P4-201ENST00000399580 1115 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
PDK4Q16654 CNN3P1-201ENST00000401596 935 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
PDK4Q16654 PKMP3-201ENST00000405497 715 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
PDK4Q16654 CTSLP8-201ENST00000413075 967 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
PDK4Q16654 TRBV30-201ENST00000417977 447 ntAPPRIS P1 BASIC7.47□□□□□ -1.21
PDK4Q16654 RPL19P21-201ENST00000424919 591 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
PDK4Q16654 GAS5-211ENST00000432536 959 ntTSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
PDK4Q16654 LINC00460-201ENST00000435024 631 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
PDK4Q16654 RPS10P3-201ENST00000439253 494 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
PDK4Q16654 AL135929.1-201ENST00000449287 552 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
PDK4Q16654 RN7SL587P-201ENST00000459853 281 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
PDK4Q16654 AC008026.1-201ENST00000460492 447 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
PDK4Q16654 AC123768.1-202ENST00000460684 461 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
PDK4Q16654 AC011005.4-201ENST00000466717 535 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
PDK4Q16654 RN7SL705P-201ENST00000481678 294 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
PDK4Q16654 RN7SL241P-201ENST00000482973 236 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
PDK4Q16654 CHN2-226ENST00000495789 725 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
PDK4Q16654 AC112225.1-201ENST00000508230 297 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
PDK4Q16654 GCSHP1-201ENST00000512554 484 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
PDK4Q16654 AC113352.1-201ENST00000513196 666 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
PDK4Q16654 AC009630.2-201ENST00000524133 570 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
PDK4Q16654 AC025252.2-201ENST00000537470 502 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
PDK4Q16654 AL132719.1-201ENST00000554515 423 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
PDK4Q16654 NUDT7-206ENST00000568787 678 ntTSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
PDK4Q16654 AC133565.1-201ENST00000569218 488 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
PDK4Q16654 AC008770.1-209ENST00000591898 356 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
PDK4Q16654 DARS-AS1-213ENST00000596410 741 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
PDK4Q16654 AC020765.1-201ENST00000604296 328 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
PDK4Q16654 AL021807.1-201ENST00000607175 565 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
PDK4Q16654 AL136985.2-201ENST00000607372 535 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
PDK4Q16654 AP003481.1-202ENST00000608214 503 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
PDK4Q16654 HNF4A-AS1-202ENST00000609152 413 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
PDK4Q16654 RN7SL3-201ENST00000610674 299 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
PDK4Q16654 MIR6745-201ENST00000612694 127 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
PDK4Q16654 AC233702.2-201ENST00000618784 583 ntTSL 4 BASIC7.47□□□□□ -1.21
PDK4Q16654 NR1I3-235ENST00000628566 1201 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
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