Protein–RNA interactions for Protein: P29374

ARID4A, AT-rich interactive domain-containing protein 4A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,257 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID4AP29374 TMEM59-204ENST00000371344 2473 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
ARID4AP29374 HSD17B4-220ENST00000513628 2225 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
ARID4AP29374 ACTR6-209ENST00000551617 1715 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
ARID4AP29374 OR52K3P-202ENST00000641797 1729 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
ARID4AP29374 DEFB105A-201ENST00000334773 330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
ARID4AP29374 MIR128-2-201ENST00000384893 84 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
ARID4AP29374 MIR122-201ENST00000385044 85 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
ARID4AP29374 RPL34-201ENST00000394665 529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
ARID4AP29374 MSRB1P1-201ENST00000396851 354 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
ARID4AP29374 AC099566.1-204ENST00000413825 943 ntTSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
ARID4AP29374 OR10U1P-201ENST00000414690 905 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
ARID4AP29374 CSE1L-AS1-201ENST00000417781 556 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
ARID4AP29374 AL121872.1-201ENST00000420327 281 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
ARID4AP29374 AL049637.1-201ENST00000424664 503 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
ARID4AP29374 MORF4L1P7-201ENST00000426038 703 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
ARID4AP29374 LINC01473-202ENST00000427108 695 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
ARID4AP29374 HMGA1P4-201ENST00000428643 334 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
ARID4AP29374 BMP6P1-201ENST00000431230 679 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
ARID4AP29374 AL008723.1-201ENST00000452181 590 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
ARID4AP29374 KIF3AP1-201ENST00000454055 611 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
ARID4AP29374 AC078857.1-201ENST00000469870 667 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
ARID4AP29374 RPL34-204ENST00000502534 560 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC9.63□□□□□ -0.87
ARID4AP29374 AC114801.1-201ENST00000512633 297 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
ARID4AP29374 AC090802.1-201ENST00000520870 445 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
ARID4AP29374 AL451137.1-201ENST00000523363 443 ntTSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
ARID4AP29374 LINC00958-202ENST00000526388 607 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
ARID4AP29374 OVCH1-AS1-201ENST00000549411 743 ntTSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
ARID4AP29374 UBE2Q2P11-201ENST00000559691 205 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
ARID4AP29374 AC090607.2-201ENST00000560331 695 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
ARID4AP29374 KCTD2-206ENST00000581589 993 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
ARID4AP29374 RPL35AP25-201ENST00000584631 330 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
ARID4AP29374 AC008392.1-201ENST00000600941 437 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
ARID4AP29374 AL445435.1-201ENST00000604232 665 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
ARID4AP29374 AC135178.6-201ENST00000605314 398 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
ARID4AP29374 AC087623.4-201ENST00000606593 695 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
ARID4AP29374 AL590560.2-201ENST00000608430 732 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
ARID4AP29374 AC016590.3-201ENST00000611171 753 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
ARID4AP29374 CC2D2B-209ENST00000618242 980 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
ARID4AP29374 AL163051.2-201ENST00000618976 735 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
ARID4AP29374 Metazoa_SRP.99-201ENST00000621370 254 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
ARID4AP29374 AC007527.2-201ENST00000621825 546 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
ARID4AP29374 AC026422.1-201ENST00000623961 452 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
ARID4AP29374 LINC01358-208ENST00000634569 1030 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
ARID4AP29374 SPRR5-201ENST00000636302 817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
ARID4AP29374 PLPPR1-202ENST00000395056 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
ARID4AP29374 PARP4-201ENST00000381989 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
ARID4AP29374 DOCK8-204ENST00000432829 7452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
ARID4AP29374 AC068733.1-202ENST00000531479 2456 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
ARID4AP29374 SLC35A3-201ENST00000370153 5708 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
ARID4AP29374 HEATR4-201ENST00000334988 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
ARID4AP29374 AC073324.1-201ENST00000425993 1435 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
ARID4AP29374 HCG18-238ENST00000449544 4262 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
ARID4AP29374 THAP12P1-201ENST00000398672 2203 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
ARID4AP29374 CORIN-207ENST00000505909 3018 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
ARID4AP29374 SPTAN1-223ENST00000630866 7498 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
ARID4AP29374 ATP1A2-202ENST00000392233 3338 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
ARID4AP29374 MAPK10-285ENST00000641207 2746 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
ARID4AP29374 RUNX1T1-203ENST00000396218 3463 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
ARID4AP29374 LINC00649-203ENST00000427447 9124 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
ARID4AP29374 AC107398.3-201ENST00000562284 7000 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
ARID4AP29374 YME1L1-201ENST00000326799 3994 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
ARID4AP29374 AL109918.1-201ENST00000602367 3039 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
ARID4AP29374 GRIA4-206ENST00000525187 2822 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
ARID4AP29374 AC117382.2-201ENST00000564748 3151 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
ARID4AP29374 GON4L-219ENST00000622608 4801 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
ARID4AP29374 CDC42-201ENST00000315554 1452 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
ARID4AP29374 AL390195.2-201ENST00000564771 2023 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
ARID4AP29374 BTK-201ENST00000308731 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
ARID4AP29374 CHD7-202ENST00000524602 3456 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
ARID4AP29374 ZNF736-202ENST00000423484 7119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
ARID4AP29374 MYB-235ENST00000533624 1818 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
ARID4AP29374 MYB-238ENST00000534044 1812 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
ARID4AP29374 AC107977.1-201ENST00000355745 939 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
ARID4AP29374 RNA5SP463-201ENST00000363030 120 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
ARID4AP29374 FCAR-205ENST00000391723 754 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
ARID4AP29374 AC087276.2-201ENST00000394183 183 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
ARID4AP29374 MGST1-205ENST00000396210 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
ARID4AP29374 MYB-206ENST00000420123 1051 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
ARID4AP29374 AJ006995.1-201ENST00000433344 572 ntTSL 3 BASIC9.62□□□□□ -0.87
ARID4AP29374 AL359502.1-201ENST00000437334 692 ntTSL 3 BASIC9.62□□□□□ -0.87
ARID4AP29374 TTC26-205ENST00000474035 1193 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
ARID4AP29374 UGT2B29P-201ENST00000509021 973 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
ARID4AP29374 AC005351.1-201ENST00000511152 786 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
ARID4AP29374 MTCO3P28-201ENST00000513351 515 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
ARID4AP29374 AC018541.1-202ENST00000518687 584 ntTSL 4 BASIC9.62□□□□□ -0.87
ARID4AP29374 VDAC3-206ENST00000521158 949 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
ARID4AP29374 LINC01974-201ENST00000575126 494 ntTSL 3 BASIC9.62□□□□□ -0.87
ARID4AP29374 MIR4258-201ENST00000580920 91 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
ARID4AP29374 AC006504.5-212ENST00000587188 746 ntTSL 3 BASIC9.62□□□□□ -0.87
ARID4AP29374 LINC00216-201ENST00000623548 1126 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
ARID4AP29374 AC012557.3-201ENST00000626439 255 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
ARID4AP29374 CCDC191-201ENST00000295878 3976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
ARID4AP29374 AC018765.1-201ENST00000623357 3446 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
ARID4AP29374 PIWIL2-205ENST00000611073 2864 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
ARID4AP29374 NCEH1-206ENST00000543711 4062 ntTSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
ARID4AP29374 MYPN-201ENST00000354393 4596 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
ARID4AP29374 TRAF6P1-201ENST00000429404 1558 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
ARID4AP29374 PROM1-210ENST00000510224 4006 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
ARID4AP29374 AL365475.1-201ENST00000565135 1949 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
ARID4AP29374 C2CD5-218ENST00000545552 3471 ntTSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.4 ms