Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXQ3

C9orf40, Uncharacterized protein C9orf40, humanhuman

Predictions only

Length 194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf40Q8IXQ3 AC095059.2-201ENST00000510601 933 ntBASIC7□□□□□ -1.29
C9orf40Q8IXQ3 AC018541.1-201ENST00000517706 764 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
C9orf40Q8IXQ3 LINC00678-202ENST00000534757 798 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
C9orf40Q8IXQ3 PSMC1P8-201ENST00000536820 1296 ntBASIC7□□□□□ -1.29
C9orf40Q8IXQ3 AC006205.2-201ENST00000538943 373 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
C9orf40Q8IXQ3 AC092868.2-201ENST00000558749 497 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
C9orf40Q8IXQ3 AC023813.3-201ENST00000561876 539 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
C9orf40Q8IXQ3 AP003071.2-201ENST00000562772 990 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
C9orf40Q8IXQ3 STARD6-204ENST00000584040 660 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
C9orf40Q8IXQ3 AC011933.4-201ENST00000585081 403 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
C9orf40Q8IXQ3 OR5AH1P-201ENST00000595968 283 ntBASIC7□□□□□ -1.29
C9orf40Q8IXQ3 ZNF714-203ENST00000596053 800 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
C9orf40Q8IXQ3 RN7SL680P-201ENST00000620379 299 ntBASIC7□□□□□ -1.29
C9orf40Q8IXQ3 AL359745.1-201ENST00000626943 760 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
C9orf40Q8IXQ3 5_8S_rRNA.6-201ENST00000637374 152 ntBASIC7□□□□□ -1.29
C9orf40Q8IXQ3 NBPF15-206ENST00000581897 4272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
C9orf40Q8IXQ3 YME1L1-201ENST00000326799 3994 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
C9orf40Q8IXQ3 SLC36A2-201ENST00000335244 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
C9orf40Q8IXQ3 VEZF1P1-201ENST00000423931 1541 ntBASIC7□□□□□ -1.29
C9orf40Q8IXQ3 AKR1C1-202ENST00000380872 6705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
C9orf40Q8IXQ3 DLG2-202ENST00000330014 2789 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
C9orf40Q8IXQ3 KCNN3-201ENST00000271915 13033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
C9orf40Q8IXQ3 LGI1-211ENST00000630047 1751 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
C9orf40Q8IXQ3 CCAR1-218ENST00000630771 4540 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
C9orf40Q8IXQ3 CACNB4-250ENST00000637418 2015 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
C9orf40Q8IXQ3 MMACHC-201ENST00000401061 5296 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
C9orf40Q8IXQ3 MBTPS2-201ENST00000365779 4457 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
C9orf40Q8IXQ3 SOCS5P5-201ENST00000402732 1586 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
C9orf40Q8IXQ3 NPIPB5-207ENST00000451409 3660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
C9orf40Q8IXQ3 FBXO40-201ENST00000338040 5929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
C9orf40Q8IXQ3 GAPVD1-207ENST00000394105 5207 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
C9orf40Q8IXQ3 KIAA0753-201ENST00000361413 4859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
C9orf40Q8IXQ3 THSD4-AS1-202ENST00000562634 2182 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
C9orf40Q8IXQ3 DLC1-202ENST00000316609 1837 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
C9orf40Q8IXQ3 RND3-202ENST00000375734 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
C9orf40Q8IXQ3 LINC01060-204ENST00000510832 2435 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
C9orf40Q8IXQ3 ZNF438-208ENST00000538351 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
C9orf40Q8IXQ3 AC087280.2-201ENST00000637205 4822 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
C9orf40Q8IXQ3 PRNT-201ENST00000326539 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
C9orf40Q8IXQ3 FSTL5-203ENST00000427802 2920 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
C9orf40Q8IXQ3 AL357556.1-201ENST00000421884 1388 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
C9orf40Q8IXQ3 PKHD1-201ENST00000340994 11589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
C9orf40Q8IXQ3 AC135012.3-201ENST00000599841 4039 ntTSL 4 BASIC6.99□□□□□ -1.29
C9orf40Q8IXQ3 CDKL5-202ENST00000379996 3449 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
C9orf40Q8IXQ3 ZSCAN12-201ENST00000361028 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
C9orf40Q8IXQ3 TDRD3-209ENST00000621840 2497 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
C9orf40Q8IXQ3 SGK1-223ENST00000528577 1850 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
C9orf40Q8IXQ3 PAGE4-201ENST00000218068 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
C9orf40Q8IXQ3 MIR498-201ENST00000385134 124 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
C9orf40Q8IXQ3 RERE-203ENST00000400907 2973 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
C9orf40Q8IXQ3 SULT1C4-202ENST00000409309 1045 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
C9orf40Q8IXQ3 NFU1P1-201ENST00000413128 774 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
C9orf40Q8IXQ3 AL391869.1-201ENST00000414581 475 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
C9orf40Q8IXQ3 AC231533.2-201ENST00000419045 978 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
C9orf40Q8IXQ3 FTH1P5-201ENST00000425761 545 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
C9orf40Q8IXQ3 AL353653.1-202ENST00000435177 539 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
C9orf40Q8IXQ3 AC006042.1-201ENST00000449931 524 ntTSL 4 BASIC6.99□□□□□ -1.29
C9orf40Q8IXQ3 LINC01053-201ENST00000457628 771 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
C9orf40Q8IXQ3 PDPN-205ENST00000487038 607 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
C9orf40Q8IXQ3 EIF3KP1-201ENST00000513279 656 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
C9orf40Q8IXQ3 AC091182.2-201ENST00000520431 578 ntTSL 4 BASIC6.99□□□□□ -1.29
C9orf40Q8IXQ3 PCAT29-202ENST00000558941 545 ntTSL 4 BASIC6.99□□□□□ -1.29
C9orf40Q8IXQ3 AC013489.1-201ENST00000561140 598 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
C9orf40Q8IXQ3 LINC02180-201ENST00000566439 1010 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
C9orf40Q8IXQ3 AC036222.1-201ENST00000579972 701 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
C9orf40Q8IXQ3 AL390058.1-201ENST00000603834 629 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
C9orf40Q8IXQ3 U47924.1-201ENST00000606539 434 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
C9orf40Q8IXQ3 pRNA.12-201ENST00000614353 90 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
C9orf40Q8IXQ3 pRNA.3-201ENST00000615048 90 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
C9orf40Q8IXQ3 AC068234.2-201ENST00000619646 522 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
C9orf40Q8IXQ3 OR10G8-202ENST00000641224 1033 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
C9orf40Q8IXQ3 RGS4-203ENST00000367909 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
C9orf40Q8IXQ3 ZADH2-202ENST00000537114 3205 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
C9orf40Q8IXQ3 MIR17HG-202ENST00000581816 2032 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
C9orf40Q8IXQ3 DIP2B-201ENST00000301180 8593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
C9orf40Q8IXQ3 ADGRF2-204ENST00000507065 3043 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
C9orf40Q8IXQ3 FARP1-219ENST00000596580 13532 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
C9orf40Q8IXQ3 KIAA0100-201ENST00000389003 6852 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
C9orf40Q8IXQ3 DDX50P1-201ENST00000438163 2400 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
C9orf40Q8IXQ3 AC051619.3-201ENST00000560646 2426 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
C9orf40Q8IXQ3 DPCR1-201ENST00000304311 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
C9orf40Q8IXQ3 CYFIP2-201ENST00000435847 3673 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
C9orf40Q8IXQ3 PRKCQ-204ENST00000610727 3077 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
C9orf40Q8IXQ3 IL22RA2-203ENST00000349184 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
C9orf40Q8IXQ3 AC021231.1-201ENST00000559246 1342 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
C9orf40Q8IXQ3 AMZ2-210ENST00000580753 1339 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
C9orf40Q8IXQ3 CORIN-208ENST00000508498 3200 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
C9orf40Q8IXQ3 SLFN13-209ENST00000533791 4121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
C9orf40Q8IXQ3 OR5AU1-202ENST00000641039 8232 ntAPPRIS P1 BASIC6.98□□□□□ -1.29
C9orf40Q8IXQ3 AL355974.1-201ENST00000618896 1708 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
C9orf40Q8IXQ3 NCOA4-204ENST00000581486 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
C9orf40Q8IXQ3 UNC79-201ENST00000256339 8400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
C9orf40Q8IXQ3 ZNF189-202ENST00000339664 3021 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
C9orf40Q8IXQ3 BCL2L14-204ENST00000396367 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
C9orf40Q8IXQ3 CYP4A11-201ENST00000310638 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
C9orf40Q8IXQ3 COBLL1-203ENST00000392717 9523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
C9orf40Q8IXQ3 Z99129.3-201ENST00000624363 6430 ntTSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
C9orf40Q8IXQ3 TMX2-201ENST00000278422 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
C9orf40Q8IXQ3 CYP4F30P-203ENST00000438109 2250 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
C9orf40Q8IXQ3 CACNB4-269ENST00000638005 4615 ntTSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.3 ms