Protein–RNA interactions for Protein: P24928

POLR2A, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2AP24928 PLA2G4A-201ENST00000367466 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
POLR2AP24928 AKAP4-202ENST00000376064 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
POLR2AP24928 ACADSB-202ENST00000368869 1599 ntTSL 2 BASIC8.7□□□□□ -1.02
POLR2AP24928 VN1R12P-201ENST00000403778 876 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
POLR2AP24928 SYNJ2-IT1-201ENST00000442328 599 ntTSL 3 BASIC8.7□□□□□ -1.02
POLR2AP24928 CYCSP44-201ENST00000448560 313 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
POLR2AP24928 AL390728.3-201ENST00000452704 270 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
POLR2AP24928 HMGB3P14-201ENST00000494195 599 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
POLR2AP24928 RDH10-203ENST00000519380 978 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
POLR2AP24928 AP003100.1-201ENST00000524772 832 ntTSL 3 BASIC8.7□□□□□ -1.02
POLR2AP24928 AL137230.1-202ENST00000553996 420 ntTSL 2 BASIC8.7□□□□□ -1.02
POLR2AP24928 AC073263.3-201ENST00000624449 858 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
POLR2AP24928 LINC01206-233ENST00000630063 878 ntTSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
POLR2AP24928 OR7E161P-202ENST00000641994 1033 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
POLR2AP24928 C3orf30-201ENST00000295622 1814 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
POLR2AP24928 BHLHB9-202ENST00000372735 5130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
POLR2AP24928 OR6N1-203ENST00000641846 2640 ntAPPRIS P1 BASIC8.7□□□□□ -1.02
POLR2AP24928 NME8-201ENST00000199447 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
POLR2AP24928 MMP10-201ENST00000279441 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
POLR2AP24928 LINC00641-202ENST00000555688 1763 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
POLR2AP24928 RGS6-205ENST00000406236 1476 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
POLR2AP24928 KCNMB2-207ENST00000452583 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
POLR2AP24928 APBB2-201ENST00000295974 8972 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC8.69□□□□□ -1.02
POLR2AP24928 AC009812.3-201ENST00000523871 3766 ntTSL 4 BASIC8.69□□□□□ -1.02
POLR2AP24928 CLTCL1-211ENST00000621271 5313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
POLR2AP24928 ARHGEF9-225ENST00000636276 4097 ntTSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
POLR2AP24928 LINC01994-201ENST00000496220 1808 ntTSL 2 BASIC8.69□□□□□ -1.02
POLR2AP24928 AC079466.1-201ENST00000587961 4453 ntTSL 2 BASIC8.69□□□□□ -1.02
POLR2AP24928 PTPRT-207ENST00000373201 12660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
POLR2AP24928 LTBP1-204ENST00000407925 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
POLR2AP24928 BTK-202ENST00000372880 2248 ntTSL 2 BASIC8.69□□□□□ -1.02
POLR2AP24928 RBM25-205ENST00000527432 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
POLR2AP24928 EEA1-201ENST00000322349 9875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
POLR2AP24928 RNA5SP308-201ENST00000362532 115 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
POLR2AP24928 WDR78-203ENST00000371026 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
POLR2AP24928 IGFL2-201ENST00000377693 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
POLR2AP24928 TRBV6-7-201ENST00000390373 344 ntAPPRIS P1 BASIC8.69□□□□□ -1.02
POLR2AP24928 METTL5-204ENST00000409340 472 ntTSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
POLR2AP24928 PLA2G12AP2-201ENST00000424744 264 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
POLR2AP24928 AP003385.1-201ENST00000426387 893 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
POLR2AP24928 WWC3-AS1-201ENST00000430057 578 ntTSL 3 BASIC8.69□□□□□ -1.02
POLR2AP24928 TIMM8BP2-201ENST00000445940 251 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
POLR2AP24928 AL354714.5-201ENST00000450131 590 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
POLR2AP24928 AC106822.1-201ENST00000502647 526 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
POLR2AP24928 AC084851.2-201ENST00000530377 364 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
POLR2AP24928 AL049844.1-201ENST00000545614 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
POLR2AP24928 TTC39C-204ENST00000577185 533 ntTSL 3 BASIC8.69□□□□□ -1.02
POLR2AP24928 AC098590.2-201ENST00000614787 281 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
POLR2AP24928 TEX41-271ENST00000628213 993 ntTSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
POLR2AP24928 MYRIP-210ENST00000539167 4635 ntTSL 2 BASIC8.69□□□□□ -1.02
POLR2AP24928 GPR182-201ENST00000300098 3451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
POLR2AP24928 OR6M2P-202ENST00000641780 2063 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
POLR2AP24928 OR9Q1-201ENST00000335397 2488 ntAPPRIS P1 BASIC8.69□□□□□ -1.02
POLR2AP24928 ZNF91-201ENST00000300619 5489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
POLR2AP24928 AC006116.1-201ENST00000587908 2171 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
POLR2AP24928 NUP210L-203ENST00000368559 5889 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
POLR2AP24928 NBPF19-203ENST00000578189 5034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
POLR2AP24928 MCM10-206ENST00000484800 3157 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
POLR2AP24928 LRRC2-202ENST00000395905 5100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
POLR2AP24928 WEE2-AS1-206ENST00000478332 2259 ntTSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
POLR2AP24928 CARF-201ENST00000320443 5209 ntTSL 2 BASIC8.68□□□□□ -1.02
POLR2AP24928 ZMYND8-203ENST00000352431 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
POLR2AP24928 BCRP8-201ENST00000412037 255 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
POLR2AP24928 KCTD9P1-201ENST00000430462 1167 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
POLR2AP24928 FUNDC2P2-202ENST00000443452 493 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
POLR2AP24928 ATP5J2-205ENST00000449683 460 ntTSL 3 BASIC8.68□□□□□ -1.02
POLR2AP24928 AC091982.1-202ENST00000473923 343 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
POLR2AP24928 RPL41-202ENST00000501597 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
POLR2AP24928 AC009167.1-201ENST00000568317 579 ntTSL 4 BASIC8.68□□□□□ -1.02
POLR2AP24928 AC136443.4-201ENST00000568759 579 ntTSL 4 BASIC8.68□□□□□ -1.02
POLR2AP24928 AC104581.3-201ENST00000573621 348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
POLR2AP24928 LINC01916-201ENST00000582028 559 ntTSL 4 BASIC8.68□□□□□ -1.02
POLR2AP24928 PPIAL4C-201ENST00000585245 600 ntAPPRIS P1 BASIC8.68□□□□□ -1.02
POLR2AP24928 AC011921.2-201ENST00000589465 152 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
POLR2AP24928 ITGB1-201ENST00000302278 3640 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
POLR2AP24928 DCAF5-208ENST00000556847 2791 ntTSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
POLR2AP24928 ACTG2-203ENST00000409731 1413 ntTSL 2 BASIC8.68□□□□□ -1.02
POLR2AP24928 SPATA31A3-201ENST00000428649 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
POLR2AP24928 SPATA31A5-201ENST00000437823 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
POLR2AP24928 GTF2H3-212ENST00000543341 3329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
POLR2AP24928 NBPF26-207ENST00000619748 2933 ntTSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
POLR2AP24928 GDPD4-201ENST00000315938 2533 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
POLR2AP24928 AC105101.1-201ENST00000623698 2873 ntTSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
POLR2AP24928 EMP1-201ENST00000256951 5921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
POLR2AP24928 ZMYND8-212ENST00000458360 3729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
POLR2AP24928 FOXP2-201ENST00000350908 2638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
POLR2AP24928 AC092646.2-201ENST00000431242 2095 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
POLR2AP24928 PABPC4L-201ENST00000421491 4944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.68□□□□□ -1.02
POLR2AP24928 ZNF396-201ENST00000306346 2788 ntTSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
POLR2AP24928 SELENOT-202ENST00000471696 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
POLR2AP24928 HSD17B4-220ENST00000513628 2225 ntTSL 2 BASIC8.68□□□□□ -1.02
POLR2AP24928 ASPM-203ENST00000367409 10887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
POLR2AP24928 LINC00410-201ENST00000419272 2018 ntTSL 2 BASIC8.68□□□□□ -1.02
POLR2AP24928 AL390195.2-201ENST00000564771 2023 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
POLR2AP24928 KANSL1-205ENST00000572904 4973 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
POLR2AP24928 MIR137HG-205ENST00000634594 3586 ntTSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
POLR2AP24928 CREM-216ENST00000429130 1476 ntTSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
POLR2AP24928 AL109918.1-201ENST00000602367 3039 ntTSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
POLR2AP24928 RCBTB1-201ENST00000258646 3816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.68□□□□□ -1.02
POLR2AP24928 LALBA-201ENST00000301046 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.1 ms