Protein–RNA interactions for Protein: O60939

SCN2B, Sodium channel subunit beta-2, humanhuman

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Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN2BO60939 AC011447.3-205ENST00000592022 1268 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SCN2BO60939 SSX2B-202ENST00000596480 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
SCN2BO60939 LINC01515-207ENST00000598092 496 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SCN2BO60939 AC243772.3-202ENST00000609662 1148 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
SCN2BO60939 5S_rRNA.20-201ENST00000612104 118 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
SCN2BO60939 AC020910.4-201ENST00000612269 540 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
SCN2BO60939 AC099654.4-201ENST00000614168 1059 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
SCN2BO60939 AC241585.4-201ENST00000640951 686 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
SCN2BO60939 C2orf83-204ENST00000641422 291 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SCN2BO60939 RBM26-AS1-202ENST00000606049 2427 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
SCN2BO60939 RAD54B-202ENST00000336148 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
SCN2BO60939 FBXL13-208ENST00000456695 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
SCN2BO60939 SIPA1L1-201ENST00000358550 6539 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SCN2BO60939 MFSD8-243ENST00000641695 1455 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
SCN2BO60939 CCDC129-203ENST00000409210 3773 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SCN2BO60939 RNF14-202ENST00000356143 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
SCN2BO60939 TMEM72-AS1-201ENST00000450287 3300 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SCN2BO60939 UBE2V2-207ENST00000523111 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
SCN2BO60939 MS4A7-202ENST00000358246 2871 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SCN2BO60939 PGM3-212ENST00000513973 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
SCN2BO60939 ZNF462-201ENST00000277225 10414 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
SCN2BO60939 ADGRL3-204ENST00000506720 4962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
SCN2BO60939 DYNC2LI1-203ENST00000398823 2903 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
SCN2BO60939 HSPD1P4-201ENST00000547203 1702 ntBASIC7.21□□□□□ -1.25
SCN2BO60939 NDRG3-203ENST00000373773 2098 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
SCN2BO60939 IL12B-201ENST00000231228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
SCN2BO60939 CUL4B-201ENST00000336592 3109 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
SCN2BO60939 AC026398.1-201ENST00000413683 3126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.25
SCN2BO60939 TMSB15B-208ENST00000620307 2286 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
SCN2BO60939 PARN-201ENST00000341484 2100 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.25
SCN2BO60939 UBAP2-201ENST00000360802 4284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
SCN2BO60939 C1orf131-203ENST00000366651 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
SCN2BO60939 HCG18-244ENST00000602516 2890 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
SCN2BO60939 CNTN4-AS1-201ENST00000442749 1640 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
SCN2BO60939 KLHL5-203ENST00000381930 3288 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
SCN2BO60939 OR5D18-201ENST00000333976 991 ntAPPRIS P1 BASIC7.21□□□□□ -1.26
SCN2BO60939 BTF3-201ENST00000335895 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
SCN2BO60939 PSMD10-203ENST00000340200 713 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
SCN2BO60939 UBE2D3-204ENST00000349311 838 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
SCN2BO60939 PSMD10-204ENST00000361815 768 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
SCN2BO60939 LEMD1-202ENST00000367151 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
SCN2BO60939 LEMD1-204ENST00000367153 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
SCN2BO60939 PDHA1-202ENST00000379804 709 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
SCN2BO60939 IGLV3-32-201ENST00000390303 383 ntAPPRIS P1 BASIC7.21□□□□□ -1.26
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SCN2BO60939 NIF3L1-206ENST00000416651 967 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
SCN2BO60939 HLA-DQB1-AS1-201ENST00000419852 552 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
SCN2BO60939 AC097468.2-201ENST00000429343 553 ntTSL 4 BASIC7.21□□□□□ -1.26
SCN2BO60939 AL162595.2-201ENST00000430677 792 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
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SCN2BO60939 RNF216-IT1-201ENST00000443837 337 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
SCN2BO60939 AC084809.2-201ENST00000444464 512 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
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SCN2BO60939 NR1I3-233ENST00000515452 1093 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
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SCN2BO60939 AC013283.1-201ENST00000557282 492 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
SCN2BO60939 ZNF286A-214ENST00000581529 560 ntTSL 4 BASIC7.21□□□□□ -1.26
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SCN2BO60939 AC073911.1-201ENST00000592296 504 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
SCN2BO60939 AL096855.2-201ENST00000605785 369 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
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SCN2BO60939 AC123788.2-201ENST00000612290 283 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
SCN2BO60939 KRTAP4-1-202ENST00000620667 737 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
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SCN2BO60939 AC130448.2-201ENST00000624082 374 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
SCN2BO60939 AC073488.2-201ENST00000631903 751 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
SCN2BO60939 GOLGB1-201ENST00000340645 11187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
SCN2BO60939 LIN7A-204ENST00000552864 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
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SCN2BO60939 NUMB-214ENST00000555238 3588 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
SCN2BO60939 NR3C1-205ENST00000415690 3789 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
SCN2BO60939 AL359922.2-201ENST00000581788 3017 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
SCN2BO60939 AP001347.1-201ENST00000428809 1332 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
SCN2BO60939 PYHIN1-202ENST00000368138 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
SCN2BO60939 ALMS1-207ENST00000614410 11700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
SCN2BO60939 FCGR2A-202ENST00000367972 1399 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
SCN2BO60939 RPL14-201ENST00000338970 7072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
SCN2BO60939 FAM49B-226ENST00000523509 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
SCN2BO60939 CAST-228ENST00000509903 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
SCN2BO60939 NAT1-206ENST00000518029 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
SCN2BO60939 SLC6A16-202ENST00000454748 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
SCN2BO60939 DIP2B-201ENST00000301180 8593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
SCN2BO60939 ZNF292-202ENST00000369577 10610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
SCN2BO60939 OTX2-AS1-201ENST00000534909 2428 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
SCN2BO60939 CTNND1-216ENST00000527467 5071 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
SCN2BO60939 CTNND1-229ENST00000531014 5053 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
SCN2BO60939 FTO-206ENST00000471389 11766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
SCN2BO60939 RNF219-201ENST00000282003 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
SCN2BO60939 CCL28-201ENST00000361115 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
SCN2BO60939 NF1P8-201ENST00000415351 1461 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
SCN2BO60939 ACSL5-201ENST00000354273 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
SCN2BO60939 GOLGA6L6-201ENST00000619213 4013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
SCN2BO60939 C14orf177-201ENST00000325812 1284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
SCN2BO60939 CSNK2B-202ENST00000375866 936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
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