Protein–RNA interactions for Protein: P24928

POLR2A, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2AP24928 BSN-201ENST00000296452 15955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
POLR2AP24928 AC005520.1-201ENST00000556551 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.77□□□□□ -1.01
POLR2AP24928 FAM205BP-202ENST00000399773 4009 ntBASIC8.77□□□□□ -1.01
POLR2AP24928 TLR3-202ENST00000504367 2310 ntTSL 2 BASIC8.77□□□□□ -1.01
POLR2AP24928 SETD5-203ENST00000402198 6827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1.01
POLR2AP24928 MYH2-204ENST00000532183 2528 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
POLR2AP24928 APOL3-202ENST00000361710 3563 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
POLR2AP24928 CSDE1-204ENST00000369530 3774 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
POLR2AP24928 ZNF665-201ENST00000396424 4159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.77□□□□□ -1.01
POLR2AP24928 GABRB3-225ENST00000638099 2752 ntTSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1.01
POLR2AP24928 GJB7-203ENST00000525899 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
POLR2AP24928 AC016027.2-201ENST00000441167 2493 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
POLR2AP24928 DNMBP-204ENST00000636706 5437 ntTSL 2 BASIC8.77□□□□□ -1.01
POLR2AP24928 GRB10-204ENST00000398812 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
POLR2AP24928 SP140-201ENST00000343805 2910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
POLR2AP24928 LINC01132-201ENST00000437601 3793 ntTSL 4 BASIC8.77□□□□□ -1.01
POLR2AP24928 PDXDC1-203ENST00000450288 4171 ntTSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1.01
POLR2AP24928 TNFRSF9-204ENST00000615230 5970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1.01
POLR2AP24928 RNA5SP238-201ENST00000365464 120 ntBASIC8.77□□□□□ -1.01
POLR2AP24928 MIR498-201ENST00000385134 124 ntBASIC8.77□□□□□ -1.01
POLR2AP24928 IGLV3-12-201ENST00000390313 356 ntAPPRIS P1 BASIC8.77□□□□□ -1.01
POLR2AP24928 OLA1P1-201ENST00000396387 1189 ntBASIC8.77□□□□□ -1.01
POLR2AP24928 AC023469.1-201ENST00000409243 469 ntTSL 3 BASIC8.77□□□□□ -1.01
POLR2AP24928 RN7SKP205-201ENST00000410999 307 ntBASIC8.77□□□□□ -1.01
POLR2AP24928 AC012513.1-201ENST00000417481 784 ntTSL 2 BASIC8.77□□□□□ -1.01
POLR2AP24928 AL133319.1-201ENST00000447848 777 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
POLR2AP24928 AC016724.1-201ENST00000453215 421 ntBASIC8.77□□□□□ -1.01
POLR2AP24928 RN7SL393P-201ENST00000463588 296 ntBASIC8.77□□□□□ -1.01
POLR2AP24928 NREP-217ENST00000509025 987 ntTSL 3 BASIC8.77□□□□□ -1.01
POLR2AP24928 STX18-IT1-201ENST00000515487 542 ntTSL 4 BASIC8.77□□□□□ -1.01
POLR2AP24928 NREP-223ENST00000515855 801 ntTSL 4 BASIC8.77□□□□□ -1.01
POLR2AP24928 OR4C7P-201ENST00000533375 919 ntBASIC8.77□□□□□ -1.01
POLR2AP24928 RPS7P1-201ENST00000571702 585 ntBASIC8.77□□□□□ -1.01
POLR2AP24928 RN7SL667P-201ENST00000582817 298 ntBASIC8.77□□□□□ -1.01
POLR2AP24928 MIR5682-201ENST00000584864 76 ntBASIC8.77□□□□□ -1.01
POLR2AP24928 AC016542.3-201ENST00000623520 619 ntBASIC8.77□□□□□ -1.01
POLR2AP24928 RACK1-235ENST00000626067 564 ntTSL 2 BASIC8.77□□□□□ -1.01
POLR2AP24928 GAPVD1-207ENST00000394105 5207 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1.01
POLR2AP24928 MED1-202ENST00000394287 2870 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
POLR2AP24928 PHACTR1-201ENST00000332995 5332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.77□□□□□ -1.01
POLR2AP24928 SPRY1-202ENST00000394339 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
POLR2AP24928 EPYC-201ENST00000261172 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
POLR2AP24928 RSL1D1-204ENST00000571133 5483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
POLR2AP24928 RAPGEF6-215ENST00000627212 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
POLR2AP24928 SYK-202ENST00000375747 4908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
POLR2AP24928 DZIP1-201ENST00000347108 7068 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
POLR2AP24928 MAGEE2-201ENST00000373359 2249 ntAPPRIS P1 BASIC8.76□□□□□ -1.01
POLR2AP24928 AKAP7-202ENST00000342266 2461 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
POLR2AP24928 CSF2RA-205ENST00000381524 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
POLR2AP24928 HSPD1P10-201ENST00000404829 1676 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
POLR2AP24928 KCNJ15-221ENST00000613499 3049 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC8.76□□□□□ -1.01
POLR2AP24928 SNORA70.5-201ENST00000365519 135 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
POLR2AP24928 ADPRM-201ENST00000379774 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
POLR2AP24928 TRBV9-201ENST00000390363 390 ntAPPRIS P1 BASIC8.76□□□□□ -1.01
POLR2AP24928 AC140479.1-201ENST00000440423 337 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
POLR2AP24928 AL161937.1-202ENST00000451960 341 ntTSL 3 BASIC8.76□□□□□ -1.01
POLR2AP24928 RN7SL325P-201ENST00000460434 283 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
POLR2AP24928 AC008417.1-201ENST00000510014 565 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
POLR2AP24928 RN7SKP64-201ENST00000517206 328 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
POLR2AP24928 AC105150.1-201ENST00000518011 551 ntTSL 3 BASIC8.76□□□□□ -1.01
POLR2AP24928 HNRNPA1P74-201ENST00000560782 835 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
POLR2AP24928 CYP1A1-205ENST00000564596 988 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
POLR2AP24928 AC069061.2-201ENST00000580686 480 ntTSL 3 BASIC8.76□□□□□ -1.01
POLR2AP24928 NPLOC4-221ENST00000625705 405 ntTSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
POLR2AP24928 RNASE9-209ENST00000557068 2703 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.76□□□□□ -1.01
POLR2AP24928 CTC1-201ENST00000315684 7021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
POLR2AP24928 COL4A6-210ENST00000621266 6627 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
POLR2AP24928 DDX21-201ENST00000354185 4711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
POLR2AP24928 PRKCQ-204ENST00000610727 3077 ntTSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
POLR2AP24928 FBXO36-202ENST00000373652 3120 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
POLR2AP24928 EEF1A1P26-201ENST00000458319 1363 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
POLR2AP24928 ACTR6-202ENST00000546902 1877 ntTSL 2 BASIC8.76□□□□□ -1.01
POLR2AP24928 NCAM1-228ENST00000621128 4698 ntTSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
POLR2AP24928 COPS4-209ENST00000511653 1695 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
POLR2AP24928 OXA1L-213ENST00000612549 2971 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
POLR2AP24928 OSGEPL1-204ENST00000519810 2216 ntTSL 2 BASIC8.76□□□□□ -1.01
POLR2AP24928 SLC34A2-201ENST00000382051 4122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
POLR2AP24928 NUGGC-201ENST00000413272 3887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
POLR2AP24928 CORO1C-202ENST00000420959 3921 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
POLR2AP24928 ZNF711-202ENST00000360700 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
POLR2AP24928 HMBOX1-201ENST00000287701 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
POLR2AP24928 AL954650.1-201ENST00000430776 2051 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
POLR2AP24928 NXT2-204ENST00000372107 937 ntTSL 3 BASIC8.75□□□□□ -1.01
POLR2AP24928 TRBV6-6-201ENST00000390371 388 ntAPPRIS P1 BASIC8.75□□□□□ -1.01
POLR2AP24928 AL138828.1-204ENST00000413745 898 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
POLR2AP24928 ZBTB8OSP2-201ENST00000423890 504 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
POLR2AP24928 RN7SL706P-201ENST00000460079 292 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
POLR2AP24928 FBXO16-207ENST00000518734 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
POLR2AP24928 AP001803.1-201ENST00000525668 147 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
POLR2AP24928 AP001000.1-201ENST00000526843 742 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
POLR2AP24928 LINC02400-201ENST00000548210 351 ntTSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
POLR2AP24928 AL683826.1-201ENST00000624104 627 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
POLR2AP24928 SERPINB11-209ENST00000624518 573 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
POLR2AP24928 AC022743.1-201ENST00000624990 664 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
POLR2AP24928 AL355480.1-201ENST00000629041 99 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
POLR2AP24928 AL161457.2-202ENST00000629161 743 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
POLR2AP24928 AL391988.1-201ENST00000614747 1553 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
POLR2AP24928 MAPK10-354ENST00000641823 2732 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
POLR2AP24928 ABCF2P1-201ENST00000465687 1867 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
POLR2AP24928 TRIM64EP-201ENST00000531233 1307 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71 ms