Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6Y1

CAMTA1, Calmodulin-binding transcription activator 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,673 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMTA1Q9Y6Y1 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CAMTA1Q9Y6Y1 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CAMTA1Q9Y6Y1 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CAMTA1Q9Y6Y1 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CAMTA1Q9Y6Y1 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
CAMTA1Q9Y6Y1 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
CAMTA1Q9Y6Y1 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CAMTA1Q9Y6Y1 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
CAMTA1Q9Y6Y1 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CAMTA1Q9Y6Y1 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CAMTA1Q9Y6Y1 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CAMTA1Q9Y6Y1 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CAMTA1Q9Y6Y1 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CAMTA1Q9Y6Y1 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CAMTA1Q9Y6Y1 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
CAMTA1Q9Y6Y1 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CAMTA1Q9Y6Y1 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
CAMTA1Q9Y6Y1 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
CAMTA1Q9Y6Y1 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CAMTA1Q9Y6Y1 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CAMTA1Q9Y6Y1 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CAMTA1Q9Y6Y1 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CAMTA1Q9Y6Y1 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CAMTA1Q9Y6Y1 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CAMTA1Q9Y6Y1 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CAMTA1Q9Y6Y1 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CAMTA1Q9Y6Y1 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CAMTA1Q9Y6Y1 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CAMTA1Q9Y6Y1 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CAMTA1Q9Y6Y1 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CAMTA1Q9Y6Y1 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.89
CAMTA1Q9Y6Y1 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
CAMTA1Q9Y6Y1 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
CAMTA1Q9Y6Y1 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CAMTA1Q9Y6Y1 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CAMTA1Q9Y6Y1 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CAMTA1Q9Y6Y1 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CAMTA1Q9Y6Y1 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
CAMTA1Q9Y6Y1 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
CAMTA1Q9Y6Y1 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CAMTA1Q9Y6Y1 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CAMTA1Q9Y6Y1 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CAMTA1Q9Y6Y1 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CAMTA1Q9Y6Y1 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CAMTA1Q9Y6Y1 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CAMTA1Q9Y6Y1 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
CAMTA1Q9Y6Y1 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CAMTA1Q9Y6Y1 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CAMTA1Q9Y6Y1 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CAMTA1Q9Y6Y1 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CAMTA1Q9Y6Y1 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CAMTA1Q9Y6Y1 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CAMTA1Q9Y6Y1 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CAMTA1Q9Y6Y1 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CAMTA1Q9Y6Y1 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CAMTA1Q9Y6Y1 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CAMTA1Q9Y6Y1 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CAMTA1Q9Y6Y1 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CAMTA1Q9Y6Y1 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
CAMTA1Q9Y6Y1 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CAMTA1Q9Y6Y1 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CAMTA1Q9Y6Y1 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CAMTA1Q9Y6Y1 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CAMTA1Q9Y6Y1 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CAMTA1Q9Y6Y1 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CAMTA1Q9Y6Y1 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CAMTA1Q9Y6Y1 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CAMTA1Q9Y6Y1 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CAMTA1Q9Y6Y1 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CAMTA1Q9Y6Y1 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CAMTA1Q9Y6Y1 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CAMTA1Q9Y6Y1 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CAMTA1Q9Y6Y1 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CAMTA1Q9Y6Y1 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
CAMTA1Q9Y6Y1 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CAMTA1Q9Y6Y1 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CAMTA1Q9Y6Y1 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CAMTA1Q9Y6Y1 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CAMTA1Q9Y6Y1 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CAMTA1Q9Y6Y1 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
CAMTA1Q9Y6Y1 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CAMTA1Q9Y6Y1 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CAMTA1Q9Y6Y1 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CAMTA1Q9Y6Y1 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CAMTA1Q9Y6Y1 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CAMTA1Q9Y6Y1 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CAMTA1Q9Y6Y1 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CAMTA1Q9Y6Y1 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CAMTA1Q9Y6Y1 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CAMTA1Q9Y6Y1 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CAMTA1Q9Y6Y1 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CAMTA1Q9Y6Y1 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CAMTA1Q9Y6Y1 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CAMTA1Q9Y6Y1 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CAMTA1Q9Y6Y1 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CAMTA1Q9Y6Y1 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CAMTA1Q9Y6Y1 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CAMTA1Q9Y6Y1 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CAMTA1Q9Y6Y1 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CAMTA1Q9Y6Y1 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms