Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R9

CCDC61, Coiled-coil domain-containing protein 61, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC61Q9Y6R9 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC61Q9Y6R9 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC61Q9Y6R9 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC61Q9Y6R9 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC61Q9Y6R9 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC61Q9Y6R9 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC61Q9Y6R9 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC61Q9Y6R9 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC61Q9Y6R9 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC61Q9Y6R9 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC61Q9Y6R9 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC61Q9Y6R9 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC61Q9Y6R9 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC61Q9Y6R9 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC61Q9Y6R9 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC61Q9Y6R9 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC61Q9Y6R9 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC61Q9Y6R9 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC61Q9Y6R9 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC61Q9Y6R9 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC61Q9Y6R9 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC61Q9Y6R9 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC61Q9Y6R9 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC61Q9Y6R9 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC61Q9Y6R9 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC61Q9Y6R9 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC61Q9Y6R9 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCDC61Q9Y6R9 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCDC61Q9Y6R9 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCDC61Q9Y6R9 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCDC61Q9Y6R9 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCDC61Q9Y6R9 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
CCDC61Q9Y6R9 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCDC61Q9Y6R9 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCDC61Q9Y6R9 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCDC61Q9Y6R9 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCDC61Q9Y6R9 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCDC61Q9Y6R9 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCDC61Q9Y6R9 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCDC61Q9Y6R9 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CCDC61Q9Y6R9 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CCDC61Q9Y6R9 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
CCDC61Q9Y6R9 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC61Q9Y6R9 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC61Q9Y6R9 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC61Q9Y6R9 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC61Q9Y6R9 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC61Q9Y6R9 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC61Q9Y6R9 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC61Q9Y6R9 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC61Q9Y6R9 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC61Q9Y6R9 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC61Q9Y6R9 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC61Q9Y6R9 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC61Q9Y6R9 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC61Q9Y6R9 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC61Q9Y6R9 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC61Q9Y6R9 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC61Q9Y6R9 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC61Q9Y6R9 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC61Q9Y6R9 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC61Q9Y6R9 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC61Q9Y6R9 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC61Q9Y6R9 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC61Q9Y6R9 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC61Q9Y6R9 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC61Q9Y6R9 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC61Q9Y6R9 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC61Q9Y6R9 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC61Q9Y6R9 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC61Q9Y6R9 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC61Q9Y6R9 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC61Q9Y6R9 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC61Q9Y6R9 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC61Q9Y6R9 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC61Q9Y6R9 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC61Q9Y6R9 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC61Q9Y6R9 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC61Q9Y6R9 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC61Q9Y6R9 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC61Q9Y6R9 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC61Q9Y6R9 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC61Q9Y6R9 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC61Q9Y6R9 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC61Q9Y6R9 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC61Q9Y6R9 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC61Q9Y6R9 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC61Q9Y6R9 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC61Q9Y6R9 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC61Q9Y6R9 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC61Q9Y6R9 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC61Q9Y6R9 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC61Q9Y6R9 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC61Q9Y6R9 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC61Q9Y6R9 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC61Q9Y6R9 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC61Q9Y6R9 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC61Q9Y6R9 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC61Q9Y6R9 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC61Q9Y6R9 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms