Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X2

SNX8, Sorting nexin-8, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX8Q9Y5X2 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
SNX8Q9Y5X2 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SNX8Q9Y5X2 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SNX8Q9Y5X2 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SNX8Q9Y5X2 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SNX8Q9Y5X2 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SNX8Q9Y5X2 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SNX8Q9Y5X2 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SNX8Q9Y5X2 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SNX8Q9Y5X2 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SNX8Q9Y5X2 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SNX8Q9Y5X2 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SNX8Q9Y5X2 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SNX8Q9Y5X2 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SNX8Q9Y5X2 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SNX8Q9Y5X2 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SNX8Q9Y5X2 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SNX8Q9Y5X2 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SNX8Q9Y5X2 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SNX8Q9Y5X2 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SNX8Q9Y5X2 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SNX8Q9Y5X2 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SNX8Q9Y5X2 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SNX8Q9Y5X2 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SNX8Q9Y5X2 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SNX8Q9Y5X2 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SNX8Q9Y5X2 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SNX8Q9Y5X2 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SNX8Q9Y5X2 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
SNX8Q9Y5X2 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SNX8Q9Y5X2 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SNX8Q9Y5X2 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SNX8Q9Y5X2 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SNX8Q9Y5X2 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SNX8Q9Y5X2 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SNX8Q9Y5X2 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SNX8Q9Y5X2 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SNX8Q9Y5X2 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SNX8Q9Y5X2 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SNX8Q9Y5X2 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SNX8Q9Y5X2 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SNX8Q9Y5X2 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SNX8Q9Y5X2 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SNX8Q9Y5X2 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SNX8Q9Y5X2 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SNX8Q9Y5X2 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SNX8Q9Y5X2 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SNX8Q9Y5X2 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SNX8Q9Y5X2 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SNX8Q9Y5X2 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SNX8Q9Y5X2 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SNX8Q9Y5X2 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SNX8Q9Y5X2 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SNX8Q9Y5X2 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SNX8Q9Y5X2 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SNX8Q9Y5X2 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SNX8Q9Y5X2 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SNX8Q9Y5X2 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SNX8Q9Y5X2 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SNX8Q9Y5X2 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SNX8Q9Y5X2 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SNX8Q9Y5X2 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SNX8Q9Y5X2 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SNX8Q9Y5X2 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SNX8Q9Y5X2 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SNX8Q9Y5X2 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SNX8Q9Y5X2 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SNX8Q9Y5X2 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SNX8Q9Y5X2 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SNX8Q9Y5X2 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SNX8Q9Y5X2 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SNX8Q9Y5X2 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SNX8Q9Y5X2 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
SNX8Q9Y5X2 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SNX8Q9Y5X2 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SNX8Q9Y5X2 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SNX8Q9Y5X2 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SNX8Q9Y5X2 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SNX8Q9Y5X2 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SNX8Q9Y5X2 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SNX8Q9Y5X2 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SNX8Q9Y5X2 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SNX8Q9Y5X2 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SNX8Q9Y5X2 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SNX8Q9Y5X2 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SNX8Q9Y5X2 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SNX8Q9Y5X2 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SNX8Q9Y5X2 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SNX8Q9Y5X2 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SNX8Q9Y5X2 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SNX8Q9Y5X2 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
SNX8Q9Y5X2 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
SNX8Q9Y5X2 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SNX8Q9Y5X2 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SNX8Q9Y5X2 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SNX8Q9Y5X2 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SNX8Q9Y5X2 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SNX8Q9Y5X2 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SNX8Q9Y5X2 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SNX8Q9Y5X2 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms