Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3E1

HDGFL3, Hepatoma-derived growth factor-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL3Q9Y3E1 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HDGFL3Q9Y3E1 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HDGFL3Q9Y3E1 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
HDGFL3Q9Y3E1 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
HDGFL3Q9Y3E1 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HDGFL3Q9Y3E1 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HDGFL3Q9Y3E1 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HDGFL3Q9Y3E1 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HDGFL3Q9Y3E1 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
HDGFL3Q9Y3E1 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HDGFL3Q9Y3E1 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HDGFL3Q9Y3E1 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HDGFL3Q9Y3E1 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HDGFL3Q9Y3E1 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HDGFL3Q9Y3E1 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HDGFL3Q9Y3E1 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HDGFL3Q9Y3E1 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HDGFL3Q9Y3E1 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HDGFL3Q9Y3E1 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HDGFL3Q9Y3E1 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HDGFL3Q9Y3E1 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
HDGFL3Q9Y3E1 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HDGFL3Q9Y3E1 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HDGFL3Q9Y3E1 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HDGFL3Q9Y3E1 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HDGFL3Q9Y3E1 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HDGFL3Q9Y3E1 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HDGFL3Q9Y3E1 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
HDGFL3Q9Y3E1 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HDGFL3Q9Y3E1 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HDGFL3Q9Y3E1 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HDGFL3Q9Y3E1 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HDGFL3Q9Y3E1 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HDGFL3Q9Y3E1 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HDGFL3Q9Y3E1 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HDGFL3Q9Y3E1 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HDGFL3Q9Y3E1 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
HDGFL3Q9Y3E1 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
HDGFL3Q9Y3E1 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HDGFL3Q9Y3E1 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HDGFL3Q9Y3E1 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HDGFL3Q9Y3E1 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HDGFL3Q9Y3E1 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
HDGFL3Q9Y3E1 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HDGFL3Q9Y3E1 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HDGFL3Q9Y3E1 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HDGFL3Q9Y3E1 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HDGFL3Q9Y3E1 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HDGFL3Q9Y3E1 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HDGFL3Q9Y3E1 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HDGFL3Q9Y3E1 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HDGFL3Q9Y3E1 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HDGFL3Q9Y3E1 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HDGFL3Q9Y3E1 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HDGFL3Q9Y3E1 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HDGFL3Q9Y3E1 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HDGFL3Q9Y3E1 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HDGFL3Q9Y3E1 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HDGFL3Q9Y3E1 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HDGFL3Q9Y3E1 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HDGFL3Q9Y3E1 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HDGFL3Q9Y3E1 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
HDGFL3Q9Y3E1 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HDGFL3Q9Y3E1 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HDGFL3Q9Y3E1 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HDGFL3Q9Y3E1 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HDGFL3Q9Y3E1 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HDGFL3Q9Y3E1 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HDGFL3Q9Y3E1 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HDGFL3Q9Y3E1 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
HDGFL3Q9Y3E1 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HDGFL3Q9Y3E1 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HDGFL3Q9Y3E1 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HDGFL3Q9Y3E1 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HDGFL3Q9Y3E1 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HDGFL3Q9Y3E1 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HDGFL3Q9Y3E1 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HDGFL3Q9Y3E1 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HDGFL3Q9Y3E1 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HDGFL3Q9Y3E1 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HDGFL3Q9Y3E1 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HDGFL3Q9Y3E1 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HDGFL3Q9Y3E1 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HDGFL3Q9Y3E1 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HDGFL3Q9Y3E1 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HDGFL3Q9Y3E1 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HDGFL3Q9Y3E1 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HDGFL3Q9Y3E1 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HDGFL3Q9Y3E1 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HDGFL3Q9Y3E1 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HDGFL3Q9Y3E1 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HDGFL3Q9Y3E1 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HDGFL3Q9Y3E1 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HDGFL3Q9Y3E1 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HDGFL3Q9Y3E1 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HDGFL3Q9Y3E1 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HDGFL3Q9Y3E1 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HDGFL3Q9Y3E1 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HDGFL3Q9Y3E1 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HDGFL3Q9Y3E1 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms