Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2U9

KLHDC2, Kelch domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHDC2Q9Y2U9 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHDC2Q9Y2U9 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHDC2Q9Y2U9 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHDC2Q9Y2U9 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHDC2Q9Y2U9 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHDC2Q9Y2U9 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHDC2Q9Y2U9 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHDC2Q9Y2U9 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHDC2Q9Y2U9 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHDC2Q9Y2U9 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHDC2Q9Y2U9 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHDC2Q9Y2U9 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHDC2Q9Y2U9 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHDC2Q9Y2U9 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHDC2Q9Y2U9 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHDC2Q9Y2U9 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHDC2Q9Y2U9 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHDC2Q9Y2U9 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHDC2Q9Y2U9 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHDC2Q9Y2U9 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHDC2Q9Y2U9 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHDC2Q9Y2U9 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHDC2Q9Y2U9 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHDC2Q9Y2U9 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHDC2Q9Y2U9 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHDC2Q9Y2U9 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHDC2Q9Y2U9 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHDC2Q9Y2U9 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHDC2Q9Y2U9 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHDC2Q9Y2U9 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHDC2Q9Y2U9 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHDC2Q9Y2U9 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHDC2Q9Y2U9 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHDC2Q9Y2U9 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHDC2Q9Y2U9 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHDC2Q9Y2U9 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHDC2Q9Y2U9 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLHDC2Q9Y2U9 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLHDC2Q9Y2U9 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLHDC2Q9Y2U9 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLHDC2Q9Y2U9 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLHDC2Q9Y2U9 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLHDC2Q9Y2U9 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLHDC2Q9Y2U9 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLHDC2Q9Y2U9 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLHDC2Q9Y2U9 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLHDC2Q9Y2U9 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLHDC2Q9Y2U9 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLHDC2Q9Y2U9 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLHDC2Q9Y2U9 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLHDC2Q9Y2U9 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLHDC2Q9Y2U9 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLHDC2Q9Y2U9 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLHDC2Q9Y2U9 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLHDC2Q9Y2U9 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHDC2Q9Y2U9 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHDC2Q9Y2U9 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHDC2Q9Y2U9 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHDC2Q9Y2U9 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHDC2Q9Y2U9 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHDC2Q9Y2U9 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHDC2Q9Y2U9 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHDC2Q9Y2U9 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHDC2Q9Y2U9 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHDC2Q9Y2U9 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHDC2Q9Y2U9 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHDC2Q9Y2U9 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHDC2Q9Y2U9 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHDC2Q9Y2U9 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHDC2Q9Y2U9 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHDC2Q9Y2U9 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHDC2Q9Y2U9 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHDC2Q9Y2U9 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHDC2Q9Y2U9 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHDC2Q9Y2U9 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHDC2Q9Y2U9 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHDC2Q9Y2U9 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHDC2Q9Y2U9 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHDC2Q9Y2U9 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHDC2Q9Y2U9 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHDC2Q9Y2U9 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KLHDC2Q9Y2U9 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KLHDC2Q9Y2U9 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KLHDC2Q9Y2U9 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KLHDC2Q9Y2U9 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KLHDC2Q9Y2U9 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KLHDC2Q9Y2U9 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KLHDC2Q9Y2U9 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KLHDC2Q9Y2U9 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KLHDC2Q9Y2U9 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KLHDC2Q9Y2U9 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KLHDC2Q9Y2U9 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KLHDC2Q9Y2U9 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KLHDC2Q9Y2U9 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
KLHDC2Q9Y2U9 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KLHDC2Q9Y2U9 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KLHDC2Q9Y2U9 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KLHDC2Q9Y2U9 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KLHDC2Q9Y2U9 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KLHDC2Q9Y2U9 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms