Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2K7

KDM2A, Lysine-specific demethylase 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM2AQ9Y2K7 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
KDM2AQ9Y2K7 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
KDM2AQ9Y2K7 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
KDM2AQ9Y2K7 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
KDM2AQ9Y2K7 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
KDM2AQ9Y2K7 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
KDM2AQ9Y2K7 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
KDM2AQ9Y2K7 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
KDM2AQ9Y2K7 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
KDM2AQ9Y2K7 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
KDM2AQ9Y2K7 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
KDM2AQ9Y2K7 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
KDM2AQ9Y2K7 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
KDM2AQ9Y2K7 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
KDM2AQ9Y2K7 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
KDM2AQ9Y2K7 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
KDM2AQ9Y2K7 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
KDM2AQ9Y2K7 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
KDM2AQ9Y2K7 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
KDM2AQ9Y2K7 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
KDM2AQ9Y2K7 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.82■■■□□ 2.2
KDM2AQ9Y2K7 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
KDM2AQ9Y2K7 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
KDM2AQ9Y2K7 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
KDM2AQ9Y2K7 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
KDM2AQ9Y2K7 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
KDM2AQ9Y2K7 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
KDM2AQ9Y2K7 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
KDM2AQ9Y2K7 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
KDM2AQ9Y2K7 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
KDM2AQ9Y2K7 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
KDM2AQ9Y2K7 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
KDM2AQ9Y2K7 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
KDM2AQ9Y2K7 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
KDM2AQ9Y2K7 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
KDM2AQ9Y2K7 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
KDM2AQ9Y2K7 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
KDM2AQ9Y2K7 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
KDM2AQ9Y2K7 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
KDM2AQ9Y2K7 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
KDM2AQ9Y2K7 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
KDM2AQ9Y2K7 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
KDM2AQ9Y2K7 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
KDM2AQ9Y2K7 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
KDM2AQ9Y2K7 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
KDM2AQ9Y2K7 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
KDM2AQ9Y2K7 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
KDM2AQ9Y2K7 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC28.8■■■□□ 2.2
KDM2AQ9Y2K7 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
KDM2AQ9Y2K7 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
KDM2AQ9Y2K7 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
KDM2AQ9Y2K7 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
KDM2AQ9Y2K7 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
KDM2AQ9Y2K7 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
KDM2AQ9Y2K7 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC28.79■■■□□ 2.2
KDM2AQ9Y2K7 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
KDM2AQ9Y2K7 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
KDM2AQ9Y2K7 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
KDM2AQ9Y2K7 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
KDM2AQ9Y2K7 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC28.78■■■□□ 2.2
KDM2AQ9Y2K7 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
KDM2AQ9Y2K7 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
KDM2AQ9Y2K7 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
KDM2AQ9Y2K7 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
KDM2AQ9Y2K7 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
KDM2AQ9Y2K7 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
KDM2AQ9Y2K7 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
KDM2AQ9Y2K7 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
KDM2AQ9Y2K7 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
KDM2AQ9Y2K7 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
KDM2AQ9Y2K7 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
KDM2AQ9Y2K7 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
KDM2AQ9Y2K7 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
KDM2AQ9Y2K7 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
KDM2AQ9Y2K7 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
KDM2AQ9Y2K7 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
KDM2AQ9Y2K7 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
KDM2AQ9Y2K7 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
KDM2AQ9Y2K7 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
KDM2AQ9Y2K7 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
KDM2AQ9Y2K7 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
KDM2AQ9Y2K7 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC28.77■■■□□ 2.2
KDM2AQ9Y2K7 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.2
KDM2AQ9Y2K7 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
KDM2AQ9Y2K7 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
KDM2AQ9Y2K7 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
KDM2AQ9Y2K7 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
KDM2AQ9Y2K7 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
KDM2AQ9Y2K7 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
KDM2AQ9Y2K7 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
KDM2AQ9Y2K7 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
KDM2AQ9Y2K7 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
KDM2AQ9Y2K7 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
KDM2AQ9Y2K7 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
KDM2AQ9Y2K7 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
KDM2AQ9Y2K7 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
KDM2AQ9Y2K7 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
KDM2AQ9Y2K7 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
KDM2AQ9Y2K7 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
KDM2AQ9Y2K7 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms