Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX0

IGSF9B, Protein turtle homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 1,349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF9BQ9UPX0 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
IGSF9BQ9UPX0 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
IGSF9BQ9UPX0 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
IGSF9BQ9UPX0 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
IGSF9BQ9UPX0 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
IGSF9BQ9UPX0 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
IGSF9BQ9UPX0 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
IGSF9BQ9UPX0 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
IGSF9BQ9UPX0 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
IGSF9BQ9UPX0 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
IGSF9BQ9UPX0 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
IGSF9BQ9UPX0 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
IGSF9BQ9UPX0 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
IGSF9BQ9UPX0 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
IGSF9BQ9UPX0 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
IGSF9BQ9UPX0 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
IGSF9BQ9UPX0 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
IGSF9BQ9UPX0 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
IGSF9BQ9UPX0 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
IGSF9BQ9UPX0 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
IGSF9BQ9UPX0 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
IGSF9BQ9UPX0 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
IGSF9BQ9UPX0 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
IGSF9BQ9UPX0 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
IGSF9BQ9UPX0 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
IGSF9BQ9UPX0 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
IGSF9BQ9UPX0 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
IGSF9BQ9UPX0 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
IGSF9BQ9UPX0 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
IGSF9BQ9UPX0 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
IGSF9BQ9UPX0 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
IGSF9BQ9UPX0 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
IGSF9BQ9UPX0 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
IGSF9BQ9UPX0 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
IGSF9BQ9UPX0 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
IGSF9BQ9UPX0 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
IGSF9BQ9UPX0 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
IGSF9BQ9UPX0 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
IGSF9BQ9UPX0 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
IGSF9BQ9UPX0 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
IGSF9BQ9UPX0 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
IGSF9BQ9UPX0 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
IGSF9BQ9UPX0 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
IGSF9BQ9UPX0 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
IGSF9BQ9UPX0 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
IGSF9BQ9UPX0 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
IGSF9BQ9UPX0 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
IGSF9BQ9UPX0 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
IGSF9BQ9UPX0 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
IGSF9BQ9UPX0 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
IGSF9BQ9UPX0 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
IGSF9BQ9UPX0 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
IGSF9BQ9UPX0 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
IGSF9BQ9UPX0 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
IGSF9BQ9UPX0 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
IGSF9BQ9UPX0 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
IGSF9BQ9UPX0 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
IGSF9BQ9UPX0 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
IGSF9BQ9UPX0 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
IGSF9BQ9UPX0 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
IGSF9BQ9UPX0 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
IGSF9BQ9UPX0 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
IGSF9BQ9UPX0 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
IGSF9BQ9UPX0 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
IGSF9BQ9UPX0 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
IGSF9BQ9UPX0 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
IGSF9BQ9UPX0 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
IGSF9BQ9UPX0 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
IGSF9BQ9UPX0 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
IGSF9BQ9UPX0 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
IGSF9BQ9UPX0 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
IGSF9BQ9UPX0 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
IGSF9BQ9UPX0 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
IGSF9BQ9UPX0 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
IGSF9BQ9UPX0 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
IGSF9BQ9UPX0 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
IGSF9BQ9UPX0 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
IGSF9BQ9UPX0 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
IGSF9BQ9UPX0 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
IGSF9BQ9UPX0 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
IGSF9BQ9UPX0 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
IGSF9BQ9UPX0 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
IGSF9BQ9UPX0 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
IGSF9BQ9UPX0 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
IGSF9BQ9UPX0 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
IGSF9BQ9UPX0 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
IGSF9BQ9UPX0 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
IGSF9BQ9UPX0 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
IGSF9BQ9UPX0 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
IGSF9BQ9UPX0 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
IGSF9BQ9UPX0 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
IGSF9BQ9UPX0 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
IGSF9BQ9UPX0 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
IGSF9BQ9UPX0 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
IGSF9BQ9UPX0 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
IGSF9BQ9UPX0 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
IGSF9BQ9UPX0 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
IGSF9BQ9UPX0 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
IGSF9BQ9UPX0 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
IGSF9BQ9UPX0 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms