Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ7

PDZRN3, E3 ubiquitin-protein ligase PDZRN3, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZRN3Q9UPQ7 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PDZRN3Q9UPQ7 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PDZRN3Q9UPQ7 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PDZRN3Q9UPQ7 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PDZRN3Q9UPQ7 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PDZRN3Q9UPQ7 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PDZRN3Q9UPQ7 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PDZRN3Q9UPQ7 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PDZRN3Q9UPQ7 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PDZRN3Q9UPQ7 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PDZRN3Q9UPQ7 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PDZRN3Q9UPQ7 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PDZRN3Q9UPQ7 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
PDZRN3Q9UPQ7 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
PDZRN3Q9UPQ7 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PDZRN3Q9UPQ7 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
PDZRN3Q9UPQ7 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PDZRN3Q9UPQ7 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PDZRN3Q9UPQ7 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PDZRN3Q9UPQ7 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PDZRN3Q9UPQ7 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
PDZRN3Q9UPQ7 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PDZRN3Q9UPQ7 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PDZRN3Q9UPQ7 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PDZRN3Q9UPQ7 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PDZRN3Q9UPQ7 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PDZRN3Q9UPQ7 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PDZRN3Q9UPQ7 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PDZRN3Q9UPQ7 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PDZRN3Q9UPQ7 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PDZRN3Q9UPQ7 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PDZRN3Q9UPQ7 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PDZRN3Q9UPQ7 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PDZRN3Q9UPQ7 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PDZRN3Q9UPQ7 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PDZRN3Q9UPQ7 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PDZRN3Q9UPQ7 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PDZRN3Q9UPQ7 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PDZRN3Q9UPQ7 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PDZRN3Q9UPQ7 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PDZRN3Q9UPQ7 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PDZRN3Q9UPQ7 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PDZRN3Q9UPQ7 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PDZRN3Q9UPQ7 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PDZRN3Q9UPQ7 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PDZRN3Q9UPQ7 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PDZRN3Q9UPQ7 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PDZRN3Q9UPQ7 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PDZRN3Q9UPQ7 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PDZRN3Q9UPQ7 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PDZRN3Q9UPQ7 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PDZRN3Q9UPQ7 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PDZRN3Q9UPQ7 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PDZRN3Q9UPQ7 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PDZRN3Q9UPQ7 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PDZRN3Q9UPQ7 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PDZRN3Q9UPQ7 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PDZRN3Q9UPQ7 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PDZRN3Q9UPQ7 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PDZRN3Q9UPQ7 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PDZRN3Q9UPQ7 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PDZRN3Q9UPQ7 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PDZRN3Q9UPQ7 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PDZRN3Q9UPQ7 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PDZRN3Q9UPQ7 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PDZRN3Q9UPQ7 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PDZRN3Q9UPQ7 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PDZRN3Q9UPQ7 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PDZRN3Q9UPQ7 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PDZRN3Q9UPQ7 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PDZRN3Q9UPQ7 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
PDZRN3Q9UPQ7 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PDZRN3Q9UPQ7 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PDZRN3Q9UPQ7 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PDZRN3Q9UPQ7 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PDZRN3Q9UPQ7 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PDZRN3Q9UPQ7 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
PDZRN3Q9UPQ7 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PDZRN3Q9UPQ7 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PDZRN3Q9UPQ7 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PDZRN3Q9UPQ7 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PDZRN3Q9UPQ7 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PDZRN3Q9UPQ7 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PDZRN3Q9UPQ7 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PDZRN3Q9UPQ7 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PDZRN3Q9UPQ7 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PDZRN3Q9UPQ7 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PDZRN3Q9UPQ7 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PDZRN3Q9UPQ7 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
PDZRN3Q9UPQ7 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PDZRN3Q9UPQ7 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PDZRN3Q9UPQ7 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PDZRN3Q9UPQ7 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PDZRN3Q9UPQ7 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PDZRN3Q9UPQ7 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PDZRN3Q9UPQ7 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PDZRN3Q9UPQ7 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PDZRN3Q9UPQ7 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PDZRN3Q9UPQ7 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PDZRN3Q9UPQ7 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms