Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKX5

ITGA11, Integrin alpha-11, humanhuman

Predictions only

Length 1,188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA11Q9UKX5 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ITGA11Q9UKX5 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ITGA11Q9UKX5 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ITGA11Q9UKX5 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ITGA11Q9UKX5 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ITGA11Q9UKX5 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
ITGA11Q9UKX5 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ITGA11Q9UKX5 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ITGA11Q9UKX5 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ITGA11Q9UKX5 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
ITGA11Q9UKX5 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ITGA11Q9UKX5 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ITGA11Q9UKX5 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ITGA11Q9UKX5 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ITGA11Q9UKX5 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ITGA11Q9UKX5 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ITGA11Q9UKX5 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ITGA11Q9UKX5 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ITGA11Q9UKX5 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ITGA11Q9UKX5 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ITGA11Q9UKX5 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ITGA11Q9UKX5 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ITGA11Q9UKX5 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ITGA11Q9UKX5 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ITGA11Q9UKX5 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ITGA11Q9UKX5 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ITGA11Q9UKX5 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ITGA11Q9UKX5 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ITGA11Q9UKX5 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ITGA11Q9UKX5 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ITGA11Q9UKX5 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ITGA11Q9UKX5 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ITGA11Q9UKX5 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ITGA11Q9UKX5 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ITGA11Q9UKX5 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ITGA11Q9UKX5 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
ITGA11Q9UKX5 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ITGA11Q9UKX5 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ITGA11Q9UKX5 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ITGA11Q9UKX5 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ITGA11Q9UKX5 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ITGA11Q9UKX5 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ITGA11Q9UKX5 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ITGA11Q9UKX5 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ITGA11Q9UKX5 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ITGA11Q9UKX5 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ITGA11Q9UKX5 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ITGA11Q9UKX5 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ITGA11Q9UKX5 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ITGA11Q9UKX5 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ITGA11Q9UKX5 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ITGA11Q9UKX5 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ITGA11Q9UKX5 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ITGA11Q9UKX5 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ITGA11Q9UKX5 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ITGA11Q9UKX5 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ITGA11Q9UKX5 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ITGA11Q9UKX5 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ITGA11Q9UKX5 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ITGA11Q9UKX5 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ITGA11Q9UKX5 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ITGA11Q9UKX5 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ITGA11Q9UKX5 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ITGA11Q9UKX5 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ITGA11Q9UKX5 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ITGA11Q9UKX5 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ITGA11Q9UKX5 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ITGA11Q9UKX5 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ITGA11Q9UKX5 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ITGA11Q9UKX5 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ITGA11Q9UKX5 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ITGA11Q9UKX5 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ITGA11Q9UKX5 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ITGA11Q9UKX5 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
ITGA11Q9UKX5 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
ITGA11Q9UKX5 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
ITGA11Q9UKX5 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ITGA11Q9UKX5 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ITGA11Q9UKX5 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ITGA11Q9UKX5 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ITGA11Q9UKX5 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ITGA11Q9UKX5 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ITGA11Q9UKX5 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ITGA11Q9UKX5 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ITGA11Q9UKX5 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ITGA11Q9UKX5 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ITGA11Q9UKX5 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
ITGA11Q9UKX5 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ITGA11Q9UKX5 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ITGA11Q9UKX5 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ITGA11Q9UKX5 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ITGA11Q9UKX5 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ITGA11Q9UKX5 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ITGA11Q9UKX5 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ITGA11Q9UKX5 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ITGA11Q9UKX5 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ITGA11Q9UKX5 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ITGA11Q9UKX5 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ITGA11Q9UKX5 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ITGA11Q9UKX5 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms