Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIS9

MBD1, Methyl-CpG-binding domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD1Q9UIS9 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MBD1Q9UIS9 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MBD1Q9UIS9 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MBD1Q9UIS9 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MBD1Q9UIS9 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MBD1Q9UIS9 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MBD1Q9UIS9 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MBD1Q9UIS9 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MBD1Q9UIS9 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MBD1Q9UIS9 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MBD1Q9UIS9 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MBD1Q9UIS9 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MBD1Q9UIS9 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MBD1Q9UIS9 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
MBD1Q9UIS9 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
MBD1Q9UIS9 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
MBD1Q9UIS9 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
MBD1Q9UIS9 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
MBD1Q9UIS9 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
MBD1Q9UIS9 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
MBD1Q9UIS9 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
MBD1Q9UIS9 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
MBD1Q9UIS9 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
MBD1Q9UIS9 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
MBD1Q9UIS9 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
MBD1Q9UIS9 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
MBD1Q9UIS9 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
MBD1Q9UIS9 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
MBD1Q9UIS9 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
MBD1Q9UIS9 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MBD1Q9UIS9 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
MBD1Q9UIS9 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
MBD1Q9UIS9 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MBD1Q9UIS9 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MBD1Q9UIS9 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
MBD1Q9UIS9 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
MBD1Q9UIS9 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
MBD1Q9UIS9 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MBD1Q9UIS9 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
MBD1Q9UIS9 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
MBD1Q9UIS9 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
MBD1Q9UIS9 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
MBD1Q9UIS9 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
MBD1Q9UIS9 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
MBD1Q9UIS9 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
MBD1Q9UIS9 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MBD1Q9UIS9 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
MBD1Q9UIS9 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
MBD1Q9UIS9 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MBD1Q9UIS9 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MBD1Q9UIS9 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
MBD1Q9UIS9 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MBD1Q9UIS9 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MBD1Q9UIS9 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
MBD1Q9UIS9 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MBD1Q9UIS9 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
MBD1Q9UIS9 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MBD1Q9UIS9 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MBD1Q9UIS9 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
MBD1Q9UIS9 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MBD1Q9UIS9 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
MBD1Q9UIS9 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MBD1Q9UIS9 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MBD1Q9UIS9 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
MBD1Q9UIS9 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
MBD1Q9UIS9 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
MBD1Q9UIS9 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
MBD1Q9UIS9 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MBD1Q9UIS9 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
MBD1Q9UIS9 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
MBD1Q9UIS9 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MBD1Q9UIS9 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MBD1Q9UIS9 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MBD1Q9UIS9 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
MBD1Q9UIS9 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
MBD1Q9UIS9 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
MBD1Q9UIS9 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MBD1Q9UIS9 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MBD1Q9UIS9 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MBD1Q9UIS9 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
MBD1Q9UIS9 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MBD1Q9UIS9 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
MBD1Q9UIS9 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
MBD1Q9UIS9 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MBD1Q9UIS9 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MBD1Q9UIS9 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MBD1Q9UIS9 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
MBD1Q9UIS9 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
MBD1Q9UIS9 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
MBD1Q9UIS9 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MBD1Q9UIS9 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MBD1Q9UIS9 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MBD1Q9UIS9 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MBD1Q9UIS9 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MBD1Q9UIS9 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MBD1Q9UIS9 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
MBD1Q9UIS9 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
MBD1Q9UIS9 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MBD1Q9UIS9 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
MBD1Q9UIS9 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms