Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGU0

TCF20, Transcription factor 20, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,960 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF20Q9UGU0 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TCF20Q9UGU0 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TCF20Q9UGU0 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TCF20Q9UGU0 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TCF20Q9UGU0 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TCF20Q9UGU0 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TCF20Q9UGU0 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TCF20Q9UGU0 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TCF20Q9UGU0 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TCF20Q9UGU0 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
TCF20Q9UGU0 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TCF20Q9UGU0 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TCF20Q9UGU0 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
TCF20Q9UGU0 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TCF20Q9UGU0 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TCF20Q9UGU0 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TCF20Q9UGU0 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TCF20Q9UGU0 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TCF20Q9UGU0 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TCF20Q9UGU0 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TCF20Q9UGU0 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TCF20Q9UGU0 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TCF20Q9UGU0 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TCF20Q9UGU0 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TCF20Q9UGU0 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TCF20Q9UGU0 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TCF20Q9UGU0 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TCF20Q9UGU0 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TCF20Q9UGU0 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TCF20Q9UGU0 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TCF20Q9UGU0 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TCF20Q9UGU0 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TCF20Q9UGU0 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TCF20Q9UGU0 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TCF20Q9UGU0 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TCF20Q9UGU0 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TCF20Q9UGU0 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TCF20Q9UGU0 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TCF20Q9UGU0 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TCF20Q9UGU0 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TCF20Q9UGU0 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TCF20Q9UGU0 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TCF20Q9UGU0 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
TCF20Q9UGU0 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TCF20Q9UGU0 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TCF20Q9UGU0 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TCF20Q9UGU0 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TCF20Q9UGU0 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
TCF20Q9UGU0 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
TCF20Q9UGU0 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TCF20Q9UGU0 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TCF20Q9UGU0 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TCF20Q9UGU0 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TCF20Q9UGU0 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TCF20Q9UGU0 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TCF20Q9UGU0 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TCF20Q9UGU0 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TCF20Q9UGU0 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TCF20Q9UGU0 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TCF20Q9UGU0 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TCF20Q9UGU0 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TCF20Q9UGU0 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TCF20Q9UGU0 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TCF20Q9UGU0 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TCF20Q9UGU0 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TCF20Q9UGU0 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TCF20Q9UGU0 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TCF20Q9UGU0 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TCF20Q9UGU0 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TCF20Q9UGU0 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TCF20Q9UGU0 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TCF20Q9UGU0 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TCF20Q9UGU0 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TCF20Q9UGU0 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TCF20Q9UGU0 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TCF20Q9UGU0 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TCF20Q9UGU0 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TCF20Q9UGU0 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TCF20Q9UGU0 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TCF20Q9UGU0 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TCF20Q9UGU0 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TCF20Q9UGU0 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TCF20Q9UGU0 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TCF20Q9UGU0 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
TCF20Q9UGU0 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TCF20Q9UGU0 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TCF20Q9UGU0 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TCF20Q9UGU0 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
TCF20Q9UGU0 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TCF20Q9UGU0 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TCF20Q9UGU0 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TCF20Q9UGU0 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TCF20Q9UGU0 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TCF20Q9UGU0 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TCF20Q9UGU0 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TCF20Q9UGU0 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
TCF20Q9UGU0 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.96
TCF20Q9UGU0 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.96
TCF20Q9UGU0 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TCF20Q9UGU0 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms