Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBZ4

APEX2, DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase 2, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APEX2Q9UBZ4 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
APEX2Q9UBZ4 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
APEX2Q9UBZ4 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
APEX2Q9UBZ4 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
APEX2Q9UBZ4 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
APEX2Q9UBZ4 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
APEX2Q9UBZ4 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
APEX2Q9UBZ4 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
APEX2Q9UBZ4 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
APEX2Q9UBZ4 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
APEX2Q9UBZ4 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
APEX2Q9UBZ4 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
APEX2Q9UBZ4 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
APEX2Q9UBZ4 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
APEX2Q9UBZ4 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
APEX2Q9UBZ4 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
APEX2Q9UBZ4 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
APEX2Q9UBZ4 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
APEX2Q9UBZ4 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
APEX2Q9UBZ4 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
APEX2Q9UBZ4 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
APEX2Q9UBZ4 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
APEX2Q9UBZ4 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
APEX2Q9UBZ4 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
APEX2Q9UBZ4 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
APEX2Q9UBZ4 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
APEX2Q9UBZ4 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
APEX2Q9UBZ4 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
APEX2Q9UBZ4 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
APEX2Q9UBZ4 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
APEX2Q9UBZ4 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
APEX2Q9UBZ4 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
APEX2Q9UBZ4 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
APEX2Q9UBZ4 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
APEX2Q9UBZ4 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
APEX2Q9UBZ4 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
APEX2Q9UBZ4 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
APEX2Q9UBZ4 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
APEX2Q9UBZ4 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
APEX2Q9UBZ4 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
APEX2Q9UBZ4 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
APEX2Q9UBZ4 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
APEX2Q9UBZ4 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
APEX2Q9UBZ4 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
APEX2Q9UBZ4 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
APEX2Q9UBZ4 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
APEX2Q9UBZ4 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
APEX2Q9UBZ4 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
APEX2Q9UBZ4 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
APEX2Q9UBZ4 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
APEX2Q9UBZ4 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
APEX2Q9UBZ4 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
APEX2Q9UBZ4 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
APEX2Q9UBZ4 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
APEX2Q9UBZ4 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
APEX2Q9UBZ4 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
APEX2Q9UBZ4 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
APEX2Q9UBZ4 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
APEX2Q9UBZ4 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
APEX2Q9UBZ4 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
APEX2Q9UBZ4 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
APEX2Q9UBZ4 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
APEX2Q9UBZ4 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
APEX2Q9UBZ4 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
APEX2Q9UBZ4 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
APEX2Q9UBZ4 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
APEX2Q9UBZ4 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
APEX2Q9UBZ4 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
APEX2Q9UBZ4 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
APEX2Q9UBZ4 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
APEX2Q9UBZ4 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
APEX2Q9UBZ4 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
APEX2Q9UBZ4 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
APEX2Q9UBZ4 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
APEX2Q9UBZ4 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
APEX2Q9UBZ4 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
APEX2Q9UBZ4 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
APEX2Q9UBZ4 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
APEX2Q9UBZ4 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
APEX2Q9UBZ4 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
APEX2Q9UBZ4 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
APEX2Q9UBZ4 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
APEX2Q9UBZ4 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
APEX2Q9UBZ4 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
APEX2Q9UBZ4 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
APEX2Q9UBZ4 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
APEX2Q9UBZ4 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
APEX2Q9UBZ4 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
APEX2Q9UBZ4 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
APEX2Q9UBZ4 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
APEX2Q9UBZ4 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
APEX2Q9UBZ4 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
APEX2Q9UBZ4 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
APEX2Q9UBZ4 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
APEX2Q9UBZ4 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
APEX2Q9UBZ4 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
APEX2Q9UBZ4 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
APEX2Q9UBZ4 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
APEX2Q9UBZ4 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
APEX2Q9UBZ4 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms