Protein–RNA interactions for Protein: Q9P278

FNIP2, Folliculin-interacting protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNIP2Q9P278 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FNIP2Q9P278 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FNIP2Q9P278 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FNIP2Q9P278 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FNIP2Q9P278 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FNIP2Q9P278 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FNIP2Q9P278 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FNIP2Q9P278 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FNIP2Q9P278 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FNIP2Q9P278 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FNIP2Q9P278 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FNIP2Q9P278 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FNIP2Q9P278 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FNIP2Q9P278 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FNIP2Q9P278 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FNIP2Q9P278 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FNIP2Q9P278 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FNIP2Q9P278 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FNIP2Q9P278 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FNIP2Q9P278 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FNIP2Q9P278 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FNIP2Q9P278 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
FNIP2Q9P278 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FNIP2Q9P278 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FNIP2Q9P278 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FNIP2Q9P278 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FNIP2Q9P278 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FNIP2Q9P278 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FNIP2Q9P278 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FNIP2Q9P278 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FNIP2Q9P278 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FNIP2Q9P278 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FNIP2Q9P278 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FNIP2Q9P278 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FNIP2Q9P278 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FNIP2Q9P278 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FNIP2Q9P278 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FNIP2Q9P278 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FNIP2Q9P278 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FNIP2Q9P278 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FNIP2Q9P278 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FNIP2Q9P278 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FNIP2Q9P278 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FNIP2Q9P278 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FNIP2Q9P278 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FNIP2Q9P278 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FNIP2Q9P278 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FNIP2Q9P278 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FNIP2Q9P278 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FNIP2Q9P278 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FNIP2Q9P278 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FNIP2Q9P278 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FNIP2Q9P278 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FNIP2Q9P278 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
FNIP2Q9P278 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FNIP2Q9P278 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FNIP2Q9P278 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FNIP2Q9P278 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FNIP2Q9P278 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FNIP2Q9P278 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FNIP2Q9P278 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FNIP2Q9P278 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FNIP2Q9P278 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FNIP2Q9P278 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FNIP2Q9P278 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FNIP2Q9P278 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FNIP2Q9P278 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FNIP2Q9P278 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
FNIP2Q9P278 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FNIP2Q9P278 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
FNIP2Q9P278 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FNIP2Q9P278 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FNIP2Q9P278 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FNIP2Q9P278 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FNIP2Q9P278 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FNIP2Q9P278 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FNIP2Q9P278 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FNIP2Q9P278 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FNIP2Q9P278 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FNIP2Q9P278 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FNIP2Q9P278 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FNIP2Q9P278 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FNIP2Q9P278 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FNIP2Q9P278 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
FNIP2Q9P278 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FNIP2Q9P278 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FNIP2Q9P278 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FNIP2Q9P278 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FNIP2Q9P278 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FNIP2Q9P278 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
FNIP2Q9P278 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
FNIP2Q9P278 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
FNIP2Q9P278 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
FNIP2Q9P278 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FNIP2Q9P278 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
FNIP2Q9P278 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC21.32■■□□□ 1
FNIP2Q9P278 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FNIP2Q9P278 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FNIP2Q9P278 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FNIP2Q9P278 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms