Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0M6

H2AFY2, Core histone macro-H2A.2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2AFY2Q9P0M6 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
H2AFY2Q9P0M6 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
H2AFY2Q9P0M6 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
H2AFY2Q9P0M6 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
H2AFY2Q9P0M6 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
H2AFY2Q9P0M6 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
H2AFY2Q9P0M6 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
H2AFY2Q9P0M6 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
H2AFY2Q9P0M6 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
H2AFY2Q9P0M6 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
H2AFY2Q9P0M6 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
H2AFY2Q9P0M6 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
H2AFY2Q9P0M6 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
H2AFY2Q9P0M6 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
H2AFY2Q9P0M6 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
H2AFY2Q9P0M6 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
H2AFY2Q9P0M6 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
H2AFY2Q9P0M6 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
H2AFY2Q9P0M6 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
H2AFY2Q9P0M6 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
H2AFY2Q9P0M6 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
H2AFY2Q9P0M6 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
H2AFY2Q9P0M6 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
H2AFY2Q9P0M6 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
H2AFY2Q9P0M6 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
H2AFY2Q9P0M6 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
H2AFY2Q9P0M6 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
H2AFY2Q9P0M6 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
H2AFY2Q9P0M6 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
H2AFY2Q9P0M6 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
H2AFY2Q9P0M6 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
H2AFY2Q9P0M6 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
H2AFY2Q9P0M6 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
H2AFY2Q9P0M6 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
H2AFY2Q9P0M6 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
H2AFY2Q9P0M6 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
H2AFY2Q9P0M6 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
H2AFY2Q9P0M6 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
H2AFY2Q9P0M6 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
H2AFY2Q9P0M6 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
H2AFY2Q9P0M6 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
H2AFY2Q9P0M6 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
H2AFY2Q9P0M6 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
H2AFY2Q9P0M6 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
H2AFY2Q9P0M6 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
H2AFY2Q9P0M6 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
H2AFY2Q9P0M6 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
H2AFY2Q9P0M6 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
H2AFY2Q9P0M6 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
H2AFY2Q9P0M6 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
H2AFY2Q9P0M6 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
H2AFY2Q9P0M6 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
H2AFY2Q9P0M6 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
H2AFY2Q9P0M6 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
H2AFY2Q9P0M6 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
H2AFY2Q9P0M6 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
H2AFY2Q9P0M6 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
H2AFY2Q9P0M6 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
H2AFY2Q9P0M6 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
H2AFY2Q9P0M6 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
H2AFY2Q9P0M6 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
H2AFY2Q9P0M6 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
H2AFY2Q9P0M6 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
H2AFY2Q9P0M6 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
H2AFY2Q9P0M6 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
H2AFY2Q9P0M6 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
H2AFY2Q9P0M6 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
H2AFY2Q9P0M6 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
H2AFY2Q9P0M6 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
H2AFY2Q9P0M6 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
H2AFY2Q9P0M6 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
H2AFY2Q9P0M6 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
H2AFY2Q9P0M6 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
H2AFY2Q9P0M6 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
H2AFY2Q9P0M6 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
H2AFY2Q9P0M6 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
H2AFY2Q9P0M6 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
H2AFY2Q9P0M6 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
H2AFY2Q9P0M6 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
H2AFY2Q9P0M6 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
H2AFY2Q9P0M6 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
H2AFY2Q9P0M6 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
H2AFY2Q9P0M6 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
H2AFY2Q9P0M6 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
H2AFY2Q9P0M6 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
H2AFY2Q9P0M6 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
H2AFY2Q9P0M6 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
H2AFY2Q9P0M6 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
H2AFY2Q9P0M6 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
H2AFY2Q9P0M6 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
H2AFY2Q9P0M6 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
H2AFY2Q9P0M6 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
H2AFY2Q9P0M6 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
H2AFY2Q9P0M6 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
H2AFY2Q9P0M6 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
H2AFY2Q9P0M6 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
H2AFY2Q9P0M6 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
H2AFY2Q9P0M6 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
H2AFY2Q9P0M6 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
H2AFY2Q9P0M6 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms