Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN3

EHD3, EH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD3Q9NZN3 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
EHD3Q9NZN3 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
EHD3Q9NZN3 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
EHD3Q9NZN3 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
EHD3Q9NZN3 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
EHD3Q9NZN3 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
EHD3Q9NZN3 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
EHD3Q9NZN3 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
EHD3Q9NZN3 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
EHD3Q9NZN3 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
EHD3Q9NZN3 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
EHD3Q9NZN3 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
EHD3Q9NZN3 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
EHD3Q9NZN3 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
EHD3Q9NZN3 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
EHD3Q9NZN3 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
EHD3Q9NZN3 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
EHD3Q9NZN3 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
EHD3Q9NZN3 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
EHD3Q9NZN3 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
EHD3Q9NZN3 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
EHD3Q9NZN3 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
EHD3Q9NZN3 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
EHD3Q9NZN3 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
EHD3Q9NZN3 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
EHD3Q9NZN3 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
EHD3Q9NZN3 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
EHD3Q9NZN3 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
EHD3Q9NZN3 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
EHD3Q9NZN3 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
EHD3Q9NZN3 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
EHD3Q9NZN3 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
EHD3Q9NZN3 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
EHD3Q9NZN3 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
EHD3Q9NZN3 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
EHD3Q9NZN3 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
EHD3Q9NZN3 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
EHD3Q9NZN3 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
EHD3Q9NZN3 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
EHD3Q9NZN3 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
EHD3Q9NZN3 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
EHD3Q9NZN3 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
EHD3Q9NZN3 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
EHD3Q9NZN3 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
EHD3Q9NZN3 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
EHD3Q9NZN3 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
EHD3Q9NZN3 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
EHD3Q9NZN3 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
EHD3Q9NZN3 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
EHD3Q9NZN3 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
EHD3Q9NZN3 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
EHD3Q9NZN3 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
EHD3Q9NZN3 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
EHD3Q9NZN3 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
EHD3Q9NZN3 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
EHD3Q9NZN3 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
EHD3Q9NZN3 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
EHD3Q9NZN3 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
EHD3Q9NZN3 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
EHD3Q9NZN3 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
EHD3Q9NZN3 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
EHD3Q9NZN3 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
EHD3Q9NZN3 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
EHD3Q9NZN3 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
EHD3Q9NZN3 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
EHD3Q9NZN3 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
EHD3Q9NZN3 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
EHD3Q9NZN3 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
EHD3Q9NZN3 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
EHD3Q9NZN3 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
EHD3Q9NZN3 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
EHD3Q9NZN3 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
EHD3Q9NZN3 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
EHD3Q9NZN3 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
EHD3Q9NZN3 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
EHD3Q9NZN3 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
EHD3Q9NZN3 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
EHD3Q9NZN3 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
EHD3Q9NZN3 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
EHD3Q9NZN3 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
EHD3Q9NZN3 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
EHD3Q9NZN3 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
EHD3Q9NZN3 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
EHD3Q9NZN3 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
EHD3Q9NZN3 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
EHD3Q9NZN3 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
EHD3Q9NZN3 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
EHD3Q9NZN3 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
EHD3Q9NZN3 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
EHD3Q9NZN3 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
EHD3Q9NZN3 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
EHD3Q9NZN3 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
EHD3Q9NZN3 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
EHD3Q9NZN3 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
EHD3Q9NZN3 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
EHD3Q9NZN3 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
EHD3Q9NZN3 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
EHD3Q9NZN3 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
EHD3Q9NZN3 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
EHD3Q9NZN3 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms