Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYL9

TMOD3, Tropomodulin-3, humanhuman

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Length 352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3Q9NYL9 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TMOD3Q9NYL9 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TMOD3Q9NYL9 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TMOD3Q9NYL9 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TMOD3Q9NYL9 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TMOD3Q9NYL9 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
TMOD3Q9NYL9 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TMOD3Q9NYL9 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TMOD3Q9NYL9 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TMOD3Q9NYL9 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TMOD3Q9NYL9 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TMOD3Q9NYL9 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TMOD3Q9NYL9 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TMOD3Q9NYL9 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TMOD3Q9NYL9 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TMOD3Q9NYL9 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TMOD3Q9NYL9 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TMOD3Q9NYL9 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
TMOD3Q9NYL9 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
TMOD3Q9NYL9 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
TMOD3Q9NYL9 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
TMOD3Q9NYL9 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TMOD3Q9NYL9 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TMOD3Q9NYL9 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TMOD3Q9NYL9 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TMOD3Q9NYL9 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TMOD3Q9NYL9 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TMOD3Q9NYL9 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TMOD3Q9NYL9 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
TMOD3Q9NYL9 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TMOD3Q9NYL9 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
TMOD3Q9NYL9 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TMOD3Q9NYL9 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TMOD3Q9NYL9 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TMOD3Q9NYL9 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TMOD3Q9NYL9 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TMOD3Q9NYL9 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TMOD3Q9NYL9 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TMOD3Q9NYL9 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TMOD3Q9NYL9 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TMOD3Q9NYL9 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TMOD3Q9NYL9 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TMOD3Q9NYL9 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TMOD3Q9NYL9 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TMOD3Q9NYL9 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TMOD3Q9NYL9 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TMOD3Q9NYL9 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TMOD3Q9NYL9 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TMOD3Q9NYL9 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TMOD3Q9NYL9 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TMOD3Q9NYL9 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TMOD3Q9NYL9 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TMOD3Q9NYL9 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TMOD3Q9NYL9 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TMOD3Q9NYL9 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TMOD3Q9NYL9 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TMOD3Q9NYL9 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TMOD3Q9NYL9 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TMOD3Q9NYL9 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TMOD3Q9NYL9 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TMOD3Q9NYL9 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TMOD3Q9NYL9 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TMOD3Q9NYL9 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TMOD3Q9NYL9 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
TMOD3Q9NYL9 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TMOD3Q9NYL9 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TMOD3Q9NYL9 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TMOD3Q9NYL9 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TMOD3Q9NYL9 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TMOD3Q9NYL9 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TMOD3Q9NYL9 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TMOD3Q9NYL9 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TMOD3Q9NYL9 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TMOD3Q9NYL9 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
TMOD3Q9NYL9 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TMOD3Q9NYL9 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC26■■□□□ 1.75
TMOD3Q9NYL9 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TMOD3Q9NYL9 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TMOD3Q9NYL9 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC26■■□□□ 1.75
TMOD3Q9NYL9 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
TMOD3Q9NYL9 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC26■■□□□ 1.75
TMOD3Q9NYL9 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC26■■□□□ 1.75
TMOD3Q9NYL9 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TMOD3Q9NYL9 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TMOD3Q9NYL9 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TMOD3Q9NYL9 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
TMOD3Q9NYL9 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TMOD3Q9NYL9 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TMOD3Q9NYL9 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TMOD3Q9NYL9 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TMOD3Q9NYL9 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TMOD3Q9NYL9 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
TMOD3Q9NYL9 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TMOD3Q9NYL9 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TMOD3Q9NYL9 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TMOD3Q9NYL9 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TMOD3Q9NYL9 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TMOD3Q9NYL9 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
TMOD3Q9NYL9 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TMOD3Q9NYL9 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
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