Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXF8

ZDHHC7, Palmitoyltransferase ZDHHC7, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZDHHC7Q9NXF8 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZDHHC7Q9NXF8 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZDHHC7Q9NXF8 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ZDHHC7Q9NXF8 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZDHHC7Q9NXF8 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZDHHC7Q9NXF8 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZDHHC7Q9NXF8 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZDHHC7Q9NXF8 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ZDHHC7Q9NXF8 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
ZDHHC7Q9NXF8 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZDHHC7Q9NXF8 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZDHHC7Q9NXF8 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ZDHHC7Q9NXF8 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZDHHC7Q9NXF8 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ZDHHC7Q9NXF8 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZDHHC7Q9NXF8 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ZDHHC7Q9NXF8 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ZDHHC7Q9NXF8 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ZDHHC7Q9NXF8 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
ZDHHC7Q9NXF8 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ZDHHC7Q9NXF8 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ZDHHC7Q9NXF8 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ZDHHC7Q9NXF8 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ZDHHC7Q9NXF8 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ZDHHC7Q9NXF8 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZDHHC7Q9NXF8 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ZDHHC7Q9NXF8 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZDHHC7Q9NXF8 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ZDHHC7Q9NXF8 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZDHHC7Q9NXF8 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZDHHC7Q9NXF8 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZDHHC7Q9NXF8 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZDHHC7Q9NXF8 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZDHHC7Q9NXF8 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZDHHC7Q9NXF8 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZDHHC7Q9NXF8 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZDHHC7Q9NXF8 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZDHHC7Q9NXF8 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZDHHC7Q9NXF8 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZDHHC7Q9NXF8 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZDHHC7Q9NXF8 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZDHHC7Q9NXF8 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZDHHC7Q9NXF8 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZDHHC7Q9NXF8 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZDHHC7Q9NXF8 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZDHHC7Q9NXF8 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZDHHC7Q9NXF8 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZDHHC7Q9NXF8 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
ZDHHC7Q9NXF8 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZDHHC7Q9NXF8 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZDHHC7Q9NXF8 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZDHHC7Q9NXF8 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZDHHC7Q9NXF8 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZDHHC7Q9NXF8 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZDHHC7Q9NXF8 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZDHHC7Q9NXF8 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZDHHC7Q9NXF8 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZDHHC7Q9NXF8 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZDHHC7Q9NXF8 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZDHHC7Q9NXF8 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZDHHC7Q9NXF8 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZDHHC7Q9NXF8 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZDHHC7Q9NXF8 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZDHHC7Q9NXF8 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZDHHC7Q9NXF8 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZDHHC7Q9NXF8 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
ZDHHC7Q9NXF8 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZDHHC7Q9NXF8 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZDHHC7Q9NXF8 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZDHHC7Q9NXF8 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZDHHC7Q9NXF8 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZDHHC7Q9NXF8 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZDHHC7Q9NXF8 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
ZDHHC7Q9NXF8 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZDHHC7Q9NXF8 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZDHHC7Q9NXF8 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZDHHC7Q9NXF8 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZDHHC7Q9NXF8 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZDHHC7Q9NXF8 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZDHHC7Q9NXF8 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZDHHC7Q9NXF8 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZDHHC7Q9NXF8 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZDHHC7Q9NXF8 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZDHHC7Q9NXF8 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZDHHC7Q9NXF8 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZDHHC7Q9NXF8 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZDHHC7Q9NXF8 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZDHHC7Q9NXF8 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZDHHC7Q9NXF8 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZDHHC7Q9NXF8 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZDHHC7Q9NXF8 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZDHHC7Q9NXF8 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZDHHC7Q9NXF8 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZDHHC7Q9NXF8 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZDHHC7Q9NXF8 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZDHHC7Q9NXF8 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZDHHC7Q9NXF8 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
ZDHHC7Q9NXF8 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZDHHC7Q9NXF8 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZDHHC7Q9NXF8 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms