Protein–RNA interactions for Protein: Q9NW68

BSDC1, BSD domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BSDC1Q9NW68 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
BSDC1Q9NW68 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
BSDC1Q9NW68 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
BSDC1Q9NW68 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
BSDC1Q9NW68 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
BSDC1Q9NW68 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
BSDC1Q9NW68 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
BSDC1Q9NW68 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
BSDC1Q9NW68 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
BSDC1Q9NW68 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
BSDC1Q9NW68 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
BSDC1Q9NW68 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
BSDC1Q9NW68 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
BSDC1Q9NW68 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
BSDC1Q9NW68 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
BSDC1Q9NW68 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
BSDC1Q9NW68 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
BSDC1Q9NW68 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
BSDC1Q9NW68 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
BSDC1Q9NW68 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
BSDC1Q9NW68 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
BSDC1Q9NW68 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
BSDC1Q9NW68 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
BSDC1Q9NW68 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
BSDC1Q9NW68 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
BSDC1Q9NW68 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
BSDC1Q9NW68 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
BSDC1Q9NW68 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
BSDC1Q9NW68 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
BSDC1Q9NW68 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
BSDC1Q9NW68 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
BSDC1Q9NW68 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
BSDC1Q9NW68 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
BSDC1Q9NW68 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
BSDC1Q9NW68 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
BSDC1Q9NW68 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
BSDC1Q9NW68 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
BSDC1Q9NW68 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
BSDC1Q9NW68 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
BSDC1Q9NW68 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
BSDC1Q9NW68 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
BSDC1Q9NW68 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
BSDC1Q9NW68 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
BSDC1Q9NW68 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
BSDC1Q9NW68 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
BSDC1Q9NW68 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
BSDC1Q9NW68 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
BSDC1Q9NW68 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
BSDC1Q9NW68 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
BSDC1Q9NW68 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
BSDC1Q9NW68 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
BSDC1Q9NW68 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
BSDC1Q9NW68 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
BSDC1Q9NW68 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
BSDC1Q9NW68 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
BSDC1Q9NW68 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
BSDC1Q9NW68 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
BSDC1Q9NW68 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
BSDC1Q9NW68 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
BSDC1Q9NW68 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
BSDC1Q9NW68 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
BSDC1Q9NW68 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
BSDC1Q9NW68 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
BSDC1Q9NW68 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
BSDC1Q9NW68 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
BSDC1Q9NW68 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.55
BSDC1Q9NW68 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
BSDC1Q9NW68 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
BSDC1Q9NW68 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
BSDC1Q9NW68 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
BSDC1Q9NW68 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
BSDC1Q9NW68 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
BSDC1Q9NW68 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
BSDC1Q9NW68 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
BSDC1Q9NW68 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
BSDC1Q9NW68 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
BSDC1Q9NW68 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
BSDC1Q9NW68 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
BSDC1Q9NW68 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
BSDC1Q9NW68 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
BSDC1Q9NW68 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
BSDC1Q9NW68 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
BSDC1Q9NW68 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
BSDC1Q9NW68 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
BSDC1Q9NW68 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
BSDC1Q9NW68 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
BSDC1Q9NW68 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
BSDC1Q9NW68 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
BSDC1Q9NW68 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
BSDC1Q9NW68 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
BSDC1Q9NW68 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
BSDC1Q9NW68 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
BSDC1Q9NW68 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
BSDC1Q9NW68 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
BSDC1Q9NW68 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
BSDC1Q9NW68 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
BSDC1Q9NW68 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
BSDC1Q9NW68 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
BSDC1Q9NW68 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
BSDC1Q9NW68 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms