Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVP2

ASF1B, Histone chaperone ASF1B, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASF1BQ9NVP2 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ASF1BQ9NVP2 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ASF1BQ9NVP2 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ASF1BQ9NVP2 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ASF1BQ9NVP2 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ASF1BQ9NVP2 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ASF1BQ9NVP2 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ASF1BQ9NVP2 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ASF1BQ9NVP2 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ASF1BQ9NVP2 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ASF1BQ9NVP2 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ASF1BQ9NVP2 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ASF1BQ9NVP2 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ASF1BQ9NVP2 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ASF1BQ9NVP2 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ASF1BQ9NVP2 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ASF1BQ9NVP2 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ASF1BQ9NVP2 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ASF1BQ9NVP2 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ASF1BQ9NVP2 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ASF1BQ9NVP2 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ASF1BQ9NVP2 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ASF1BQ9NVP2 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ASF1BQ9NVP2 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ASF1BQ9NVP2 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ASF1BQ9NVP2 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ASF1BQ9NVP2 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ASF1BQ9NVP2 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ASF1BQ9NVP2 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ASF1BQ9NVP2 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ASF1BQ9NVP2 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ASF1BQ9NVP2 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ASF1BQ9NVP2 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ASF1BQ9NVP2 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ASF1BQ9NVP2 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ASF1BQ9NVP2 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ASF1BQ9NVP2 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ASF1BQ9NVP2 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ASF1BQ9NVP2 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ASF1BQ9NVP2 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ASF1BQ9NVP2 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ASF1BQ9NVP2 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ASF1BQ9NVP2 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ASF1BQ9NVP2 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ASF1BQ9NVP2 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ASF1BQ9NVP2 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ASF1BQ9NVP2 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ASF1BQ9NVP2 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ASF1BQ9NVP2 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ASF1BQ9NVP2 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ASF1BQ9NVP2 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ASF1BQ9NVP2 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ASF1BQ9NVP2 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ASF1BQ9NVP2 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ASF1BQ9NVP2 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ASF1BQ9NVP2 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ASF1BQ9NVP2 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ASF1BQ9NVP2 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ASF1BQ9NVP2 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ASF1BQ9NVP2 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ASF1BQ9NVP2 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ASF1BQ9NVP2 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ASF1BQ9NVP2 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ASF1BQ9NVP2 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ASF1BQ9NVP2 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ASF1BQ9NVP2 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ASF1BQ9NVP2 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ASF1BQ9NVP2 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ASF1BQ9NVP2 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ASF1BQ9NVP2 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ASF1BQ9NVP2 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ASF1BQ9NVP2 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ASF1BQ9NVP2 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ASF1BQ9NVP2 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ASF1BQ9NVP2 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ASF1BQ9NVP2 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ASF1BQ9NVP2 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ASF1BQ9NVP2 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ASF1BQ9NVP2 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ASF1BQ9NVP2 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ASF1BQ9NVP2 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ASF1BQ9NVP2 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ASF1BQ9NVP2 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ASF1BQ9NVP2 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ASF1BQ9NVP2 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ASF1BQ9NVP2 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ASF1BQ9NVP2 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ASF1BQ9NVP2 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ASF1BQ9NVP2 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ASF1BQ9NVP2 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ASF1BQ9NVP2 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ASF1BQ9NVP2 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ASF1BQ9NVP2 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ASF1BQ9NVP2 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ASF1BQ9NVP2 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
ASF1BQ9NVP2 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ASF1BQ9NVP2 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ASF1BQ9NVP2 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ASF1BQ9NVP2 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ASF1BQ9NVP2 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms