Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUQ8

ABCF3, ATP-binding cassette sub-family F member 3, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCF3Q9NUQ8 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ABCF3Q9NUQ8 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ABCF3Q9NUQ8 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ABCF3Q9NUQ8 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ABCF3Q9NUQ8 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ABCF3Q9NUQ8 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ABCF3Q9NUQ8 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ABCF3Q9NUQ8 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ABCF3Q9NUQ8 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
ABCF3Q9NUQ8 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
ABCF3Q9NUQ8 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
ABCF3Q9NUQ8 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ABCF3Q9NUQ8 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ABCF3Q9NUQ8 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ABCF3Q9NUQ8 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ABCF3Q9NUQ8 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ABCF3Q9NUQ8 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ABCF3Q9NUQ8 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ABCF3Q9NUQ8 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ABCF3Q9NUQ8 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ABCF3Q9NUQ8 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
ABCF3Q9NUQ8 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ABCF3Q9NUQ8 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ABCF3Q9NUQ8 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ABCF3Q9NUQ8 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ABCF3Q9NUQ8 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ABCF3Q9NUQ8 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ABCF3Q9NUQ8 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ABCF3Q9NUQ8 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ABCF3Q9NUQ8 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ABCF3Q9NUQ8 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ABCF3Q9NUQ8 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ABCF3Q9NUQ8 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
ABCF3Q9NUQ8 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ABCF3Q9NUQ8 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ABCF3Q9NUQ8 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ABCF3Q9NUQ8 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ABCF3Q9NUQ8 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
ABCF3Q9NUQ8 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ABCF3Q9NUQ8 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ABCF3Q9NUQ8 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ABCF3Q9NUQ8 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ABCF3Q9NUQ8 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ABCF3Q9NUQ8 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ABCF3Q9NUQ8 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ABCF3Q9NUQ8 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ABCF3Q9NUQ8 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ABCF3Q9NUQ8 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ABCF3Q9NUQ8 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ABCF3Q9NUQ8 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ABCF3Q9NUQ8 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ABCF3Q9NUQ8 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ABCF3Q9NUQ8 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ABCF3Q9NUQ8 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ABCF3Q9NUQ8 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ABCF3Q9NUQ8 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ABCF3Q9NUQ8 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ABCF3Q9NUQ8 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ABCF3Q9NUQ8 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ABCF3Q9NUQ8 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ABCF3Q9NUQ8 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ABCF3Q9NUQ8 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ABCF3Q9NUQ8 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ABCF3Q9NUQ8 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ABCF3Q9NUQ8 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ABCF3Q9NUQ8 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ABCF3Q9NUQ8 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ABCF3Q9NUQ8 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ABCF3Q9NUQ8 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ABCF3Q9NUQ8 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ABCF3Q9NUQ8 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ABCF3Q9NUQ8 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ABCF3Q9NUQ8 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ABCF3Q9NUQ8 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ABCF3Q9NUQ8 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ABCF3Q9NUQ8 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ABCF3Q9NUQ8 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ABCF3Q9NUQ8 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ABCF3Q9NUQ8 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ABCF3Q9NUQ8 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ABCF3Q9NUQ8 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ABCF3Q9NUQ8 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ABCF3Q9NUQ8 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ABCF3Q9NUQ8 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
ABCF3Q9NUQ8 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ABCF3Q9NUQ8 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ABCF3Q9NUQ8 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ABCF3Q9NUQ8 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ABCF3Q9NUQ8 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ABCF3Q9NUQ8 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ABCF3Q9NUQ8 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ABCF3Q9NUQ8 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ABCF3Q9NUQ8 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ABCF3Q9NUQ8 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ABCF3Q9NUQ8 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ABCF3Q9NUQ8 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ABCF3Q9NUQ8 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
ABCF3Q9NUQ8 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ABCF3Q9NUQ8 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ABCF3Q9NUQ8 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms