Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT99

LRRC4B, Leucine-rich repeat-containing protein 4B, humanhuman

Predictions only

Length 713 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC4BQ9NT99 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
LRRC4BQ9NT99 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LRRC4BQ9NT99 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LRRC4BQ9NT99 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LRRC4BQ9NT99 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
LRRC4BQ9NT99 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LRRC4BQ9NT99 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LRRC4BQ9NT99 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
LRRC4BQ9NT99 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LRRC4BQ9NT99 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LRRC4BQ9NT99 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
LRRC4BQ9NT99 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LRRC4BQ9NT99 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
LRRC4BQ9NT99 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
LRRC4BQ9NT99 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
LRRC4BQ9NT99 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LRRC4BQ9NT99 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
LRRC4BQ9NT99 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LRRC4BQ9NT99 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
LRRC4BQ9NT99 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LRRC4BQ9NT99 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LRRC4BQ9NT99 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LRRC4BQ9NT99 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LRRC4BQ9NT99 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LRRC4BQ9NT99 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LRRC4BQ9NT99 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LRRC4BQ9NT99 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LRRC4BQ9NT99 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LRRC4BQ9NT99 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LRRC4BQ9NT99 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LRRC4BQ9NT99 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LRRC4BQ9NT99 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LRRC4BQ9NT99 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LRRC4BQ9NT99 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LRRC4BQ9NT99 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LRRC4BQ9NT99 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LRRC4BQ9NT99 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LRRC4BQ9NT99 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LRRC4BQ9NT99 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LRRC4BQ9NT99 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LRRC4BQ9NT99 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LRRC4BQ9NT99 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LRRC4BQ9NT99 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LRRC4BQ9NT99 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LRRC4BQ9NT99 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LRRC4BQ9NT99 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LRRC4BQ9NT99 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LRRC4BQ9NT99 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
LRRC4BQ9NT99 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LRRC4BQ9NT99 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LRRC4BQ9NT99 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LRRC4BQ9NT99 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LRRC4BQ9NT99 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LRRC4BQ9NT99 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LRRC4BQ9NT99 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LRRC4BQ9NT99 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LRRC4BQ9NT99 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LRRC4BQ9NT99 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
LRRC4BQ9NT99 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LRRC4BQ9NT99 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LRRC4BQ9NT99 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LRRC4BQ9NT99 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LRRC4BQ9NT99 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LRRC4BQ9NT99 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
LRRC4BQ9NT99 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
LRRC4BQ9NT99 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LRRC4BQ9NT99 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LRRC4BQ9NT99 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LRRC4BQ9NT99 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
LRRC4BQ9NT99 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
LRRC4BQ9NT99 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LRRC4BQ9NT99 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LRRC4BQ9NT99 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LRRC4BQ9NT99 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LRRC4BQ9NT99 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LRRC4BQ9NT99 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LRRC4BQ9NT99 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LRRC4BQ9NT99 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LRRC4BQ9NT99 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LRRC4BQ9NT99 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LRRC4BQ9NT99 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LRRC4BQ9NT99 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LRRC4BQ9NT99 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LRRC4BQ9NT99 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LRRC4BQ9NT99 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LRRC4BQ9NT99 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LRRC4BQ9NT99 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LRRC4BQ9NT99 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
LRRC4BQ9NT99 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LRRC4BQ9NT99 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
LRRC4BQ9NT99 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
LRRC4BQ9NT99 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LRRC4BQ9NT99 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LRRC4BQ9NT99 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
LRRC4BQ9NT99 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
LRRC4BQ9NT99 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
LRRC4BQ9NT99 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
LRRC4BQ9NT99 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
LRRC4BQ9NT99 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
LRRC4BQ9NT99 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms