Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA3

CTNNBIP1, Beta-catenin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNBIP1Q9NSA3 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTNNBIP1Q9NSA3 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTNNBIP1Q9NSA3 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTNNBIP1Q9NSA3 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTNNBIP1Q9NSA3 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTNNBIP1Q9NSA3 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTNNBIP1Q9NSA3 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTNNBIP1Q9NSA3 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTNNBIP1Q9NSA3 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTNNBIP1Q9NSA3 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTNNBIP1Q9NSA3 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTNNBIP1Q9NSA3 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTNNBIP1Q9NSA3 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTNNBIP1Q9NSA3 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTNNBIP1Q9NSA3 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTNNBIP1Q9NSA3 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTNNBIP1Q9NSA3 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTNNBIP1Q9NSA3 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTNNBIP1Q9NSA3 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTNNBIP1Q9NSA3 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTNNBIP1Q9NSA3 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTNNBIP1Q9NSA3 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTNNBIP1Q9NSA3 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTNNBIP1Q9NSA3 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTNNBIP1Q9NSA3 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTNNBIP1Q9NSA3 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTNNBIP1Q9NSA3 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTNNBIP1Q9NSA3 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTNNBIP1Q9NSA3 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTNNBIP1Q9NSA3 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTNNBIP1Q9NSA3 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTNNBIP1Q9NSA3 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTNNBIP1Q9NSA3 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTNNBIP1Q9NSA3 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTNNBIP1Q9NSA3 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTNNBIP1Q9NSA3 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTNNBIP1Q9NSA3 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTNNBIP1Q9NSA3 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTNNBIP1Q9NSA3 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CTNNBIP1Q9NSA3 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CTNNBIP1Q9NSA3 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CTNNBIP1Q9NSA3 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CTNNBIP1Q9NSA3 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CTNNBIP1Q9NSA3 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CTNNBIP1Q9NSA3 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CTNNBIP1Q9NSA3 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CTNNBIP1Q9NSA3 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CTNNBIP1Q9NSA3 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CTNNBIP1Q9NSA3 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CTNNBIP1Q9NSA3 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CTNNBIP1Q9NSA3 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CTNNBIP1Q9NSA3 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CTNNBIP1Q9NSA3 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CTNNBIP1Q9NSA3 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CTNNBIP1Q9NSA3 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CTNNBIP1Q9NSA3 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CTNNBIP1Q9NSA3 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CTNNBIP1Q9NSA3 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CTNNBIP1Q9NSA3 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CTNNBIP1Q9NSA3 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CTNNBIP1Q9NSA3 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CTNNBIP1Q9NSA3 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CTNNBIP1Q9NSA3 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CTNNBIP1Q9NSA3 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CTNNBIP1Q9NSA3 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CTNNBIP1Q9NSA3 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CTNNBIP1Q9NSA3 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CTNNBIP1Q9NSA3 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CTNNBIP1Q9NSA3 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CTNNBIP1Q9NSA3 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CTNNBIP1Q9NSA3 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CTNNBIP1Q9NSA3 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CTNNBIP1Q9NSA3 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CTNNBIP1Q9NSA3 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CTNNBIP1Q9NSA3 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CTNNBIP1Q9NSA3 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CTNNBIP1Q9NSA3 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CTNNBIP1Q9NSA3 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CTNNBIP1Q9NSA3 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CTNNBIP1Q9NSA3 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CTNNBIP1Q9NSA3 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CTNNBIP1Q9NSA3 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CTNNBIP1Q9NSA3 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CTNNBIP1Q9NSA3 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CTNNBIP1Q9NSA3 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CTNNBIP1Q9NSA3 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CTNNBIP1Q9NSA3 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CTNNBIP1Q9NSA3 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CTNNBIP1Q9NSA3 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms