Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS56

TOPORS, E3 ubiquitin-protein ligase Topors, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,045 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPORSQ9NS56 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TOPORSQ9NS56 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TOPORSQ9NS56 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TOPORSQ9NS56 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TOPORSQ9NS56 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TOPORSQ9NS56 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TOPORSQ9NS56 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TOPORSQ9NS56 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TOPORSQ9NS56 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TOPORSQ9NS56 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TOPORSQ9NS56 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TOPORSQ9NS56 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TOPORSQ9NS56 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TOPORSQ9NS56 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
TOPORSQ9NS56 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
TOPORSQ9NS56 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
TOPORSQ9NS56 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TOPORSQ9NS56 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TOPORSQ9NS56 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TOPORSQ9NS56 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TOPORSQ9NS56 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TOPORSQ9NS56 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TOPORSQ9NS56 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TOPORSQ9NS56 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TOPORSQ9NS56 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TOPORSQ9NS56 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TOPORSQ9NS56 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TOPORSQ9NS56 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TOPORSQ9NS56 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TOPORSQ9NS56 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TOPORSQ9NS56 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TOPORSQ9NS56 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TOPORSQ9NS56 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TOPORSQ9NS56 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TOPORSQ9NS56 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TOPORSQ9NS56 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TOPORSQ9NS56 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TOPORSQ9NS56 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TOPORSQ9NS56 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TOPORSQ9NS56 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TOPORSQ9NS56 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TOPORSQ9NS56 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TOPORSQ9NS56 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TOPORSQ9NS56 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TOPORSQ9NS56 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TOPORSQ9NS56 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TOPORSQ9NS56 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TOPORSQ9NS56 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TOPORSQ9NS56 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TOPORSQ9NS56 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TOPORSQ9NS56 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TOPORSQ9NS56 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TOPORSQ9NS56 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TOPORSQ9NS56 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TOPORSQ9NS56 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TOPORSQ9NS56 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TOPORSQ9NS56 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TOPORSQ9NS56 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TOPORSQ9NS56 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TOPORSQ9NS56 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TOPORSQ9NS56 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TOPORSQ9NS56 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TOPORSQ9NS56 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TOPORSQ9NS56 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TOPORSQ9NS56 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TOPORSQ9NS56 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TOPORSQ9NS56 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TOPORSQ9NS56 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TOPORSQ9NS56 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TOPORSQ9NS56 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TOPORSQ9NS56 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TOPORSQ9NS56 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TOPORSQ9NS56 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TOPORSQ9NS56 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TOPORSQ9NS56 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TOPORSQ9NS56 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TOPORSQ9NS56 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TOPORSQ9NS56 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TOPORSQ9NS56 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TOPORSQ9NS56 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TOPORSQ9NS56 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TOPORSQ9NS56 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TOPORSQ9NS56 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
TOPORSQ9NS56 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TOPORSQ9NS56 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TOPORSQ9NS56 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
TOPORSQ9NS56 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TOPORSQ9NS56 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TOPORSQ9NS56 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TOPORSQ9NS56 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TOPORSQ9NS56 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TOPORSQ9NS56 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TOPORSQ9NS56 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TOPORSQ9NS56 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TOPORSQ9NS56 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TOPORSQ9NS56 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TOPORSQ9NS56 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TOPORSQ9NS56 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TOPORSQ9NS56 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
TOPORSQ9NS56 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms