Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS15

LTBP3, Latent-transforming growth factor beta-binding protein 3, humanhuman

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Length 1,303 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBP3Q9NS15 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
LTBP3Q9NS15 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LTBP3Q9NS15 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LTBP3Q9NS15 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
LTBP3Q9NS15 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LTBP3Q9NS15 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LTBP3Q9NS15 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LTBP3Q9NS15 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LTBP3Q9NS15 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
LTBP3Q9NS15 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
LTBP3Q9NS15 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
LTBP3Q9NS15 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LTBP3Q9NS15 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LTBP3Q9NS15 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LTBP3Q9NS15 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
LTBP3Q9NS15 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LTBP3Q9NS15 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LTBP3Q9NS15 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LTBP3Q9NS15 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LTBP3Q9NS15 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LTBP3Q9NS15 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
LTBP3Q9NS15 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LTBP3Q9NS15 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LTBP3Q9NS15 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
LTBP3Q9NS15 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LTBP3Q9NS15 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
LTBP3Q9NS15 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LTBP3Q9NS15 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LTBP3Q9NS15 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LTBP3Q9NS15 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LTBP3Q9NS15 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LTBP3Q9NS15 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LTBP3Q9NS15 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LTBP3Q9NS15 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LTBP3Q9NS15 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LTBP3Q9NS15 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LTBP3Q9NS15 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LTBP3Q9NS15 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LTBP3Q9NS15 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
LTBP3Q9NS15 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LTBP3Q9NS15 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LTBP3Q9NS15 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LTBP3Q9NS15 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LTBP3Q9NS15 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LTBP3Q9NS15 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LTBP3Q9NS15 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LTBP3Q9NS15 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LTBP3Q9NS15 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LTBP3Q9NS15 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LTBP3Q9NS15 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LTBP3Q9NS15 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
LTBP3Q9NS15 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
LTBP3Q9NS15 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LTBP3Q9NS15 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LTBP3Q9NS15 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LTBP3Q9NS15 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LTBP3Q9NS15 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LTBP3Q9NS15 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
LTBP3Q9NS15 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LTBP3Q9NS15 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LTBP3Q9NS15 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LTBP3Q9NS15 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LTBP3Q9NS15 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LTBP3Q9NS15 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LTBP3Q9NS15 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LTBP3Q9NS15 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LTBP3Q9NS15 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
LTBP3Q9NS15 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
LTBP3Q9NS15 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LTBP3Q9NS15 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LTBP3Q9NS15 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LTBP3Q9NS15 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LTBP3Q9NS15 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LTBP3Q9NS15 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
LTBP3Q9NS15 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LTBP3Q9NS15 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LTBP3Q9NS15 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
LTBP3Q9NS15 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
LTBP3Q9NS15 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
LTBP3Q9NS15 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
LTBP3Q9NS15 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
LTBP3Q9NS15 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
LTBP3Q9NS15 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
LTBP3Q9NS15 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
LTBP3Q9NS15 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
LTBP3Q9NS15 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
LTBP3Q9NS15 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
LTBP3Q9NS15 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
LTBP3Q9NS15 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
LTBP3Q9NS15 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LTBP3Q9NS15 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LTBP3Q9NS15 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LTBP3Q9NS15 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LTBP3Q9NS15 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LTBP3Q9NS15 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LTBP3Q9NS15 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
LTBP3Q9NS15 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LTBP3Q9NS15 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
LTBP3Q9NS15 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LTBP3Q9NS15 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
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